Protein–RNA interactions for Protein: Q6ICC9

RTL6, Retrotransposon Gag-like protein 6, humanhuman

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Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL6Q6ICC9 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RTL6Q6ICC9 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RTL6Q6ICC9 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RTL6Q6ICC9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RTL6Q6ICC9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RTL6Q6ICC9 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
RTL6Q6ICC9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RTL6Q6ICC9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RTL6Q6ICC9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RTL6Q6ICC9 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RTL6Q6ICC9 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RTL6Q6ICC9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RTL6Q6ICC9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
RTL6Q6ICC9 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RTL6Q6ICC9 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RTL6Q6ICC9 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RTL6Q6ICC9 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
RTL6Q6ICC9 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RTL6Q6ICC9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RTL6Q6ICC9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RTL6Q6ICC9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
RTL6Q6ICC9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RTL6Q6ICC9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RTL6Q6ICC9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RTL6Q6ICC9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RTL6Q6ICC9 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RTL6Q6ICC9 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RTL6Q6ICC9 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RTL6Q6ICC9 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
RTL6Q6ICC9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RTL6Q6ICC9 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RTL6Q6ICC9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RTL6Q6ICC9 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RTL6Q6ICC9 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RTL6Q6ICC9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RTL6Q6ICC9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RTL6Q6ICC9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RTL6Q6ICC9 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RTL6Q6ICC9 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RTL6Q6ICC9 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RTL6Q6ICC9 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RTL6Q6ICC9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RTL6Q6ICC9 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RTL6Q6ICC9 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RTL6Q6ICC9 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RTL6Q6ICC9 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RTL6Q6ICC9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RTL6Q6ICC9 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RTL6Q6ICC9 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RTL6Q6ICC9 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RTL6Q6ICC9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RTL6Q6ICC9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RTL6Q6ICC9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RTL6Q6ICC9 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RTL6Q6ICC9 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RTL6Q6ICC9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RTL6Q6ICC9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RTL6Q6ICC9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RTL6Q6ICC9 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RTL6Q6ICC9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RTL6Q6ICC9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RTL6Q6ICC9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RTL6Q6ICC9 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RTL6Q6ICC9 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RTL6Q6ICC9 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RTL6Q6ICC9 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RTL6Q6ICC9 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RTL6Q6ICC9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RTL6Q6ICC9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RTL6Q6ICC9 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
RTL6Q6ICC9 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RTL6Q6ICC9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RTL6Q6ICC9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RTL6Q6ICC9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
RTL6Q6ICC9 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RTL6Q6ICC9 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
RTL6Q6ICC9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RTL6Q6ICC9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RTL6Q6ICC9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RTL6Q6ICC9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RTL6Q6ICC9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RTL6Q6ICC9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RTL6Q6ICC9 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RTL6Q6ICC9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RTL6Q6ICC9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RTL6Q6ICC9 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RTL6Q6ICC9 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
RTL6Q6ICC9 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RTL6Q6ICC9 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RTL6Q6ICC9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RTL6Q6ICC9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RTL6Q6ICC9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RTL6Q6ICC9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RTL6Q6ICC9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RTL6Q6ICC9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RTL6Q6ICC9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RTL6Q6ICC9 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RTL6Q6ICC9 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RTL6Q6ICC9 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
RTL6Q6ICC9 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
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