Protein–RNA interactions for Protein: Q5W041

ARMC3, Armadillo repeat-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 872 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARMC3Q5W041 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARMC3Q5W041 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARMC3Q5W041 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARMC3Q5W041 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARMC3Q5W041 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARMC3Q5W041 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARMC3Q5W041 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARMC3Q5W041 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARMC3Q5W041 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARMC3Q5W041 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARMC3Q5W041 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARMC3Q5W041 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARMC3Q5W041 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARMC3Q5W041 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARMC3Q5W041 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARMC3Q5W041 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ARMC3Q5W041 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARMC3Q5W041 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARMC3Q5W041 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARMC3Q5W041 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARMC3Q5W041 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARMC3Q5W041 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ARMC3Q5W041 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARMC3Q5W041 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARMC3Q5W041 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARMC3Q5W041 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARMC3Q5W041 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARMC3Q5W041 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ARMC3Q5W041 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARMC3Q5W041 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARMC3Q5W041 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARMC3Q5W041 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARMC3Q5W041 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARMC3Q5W041 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ARMC3Q5W041 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARMC3Q5W041 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARMC3Q5W041 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARMC3Q5W041 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARMC3Q5W041 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARMC3Q5W041 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARMC3Q5W041 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARMC3Q5W041 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARMC3Q5W041 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ARMC3Q5W041 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARMC3Q5W041 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARMC3Q5W041 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARMC3Q5W041 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARMC3Q5W041 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARMC3Q5W041 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARMC3Q5W041 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARMC3Q5W041 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARMC3Q5W041 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ARMC3Q5W041 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARMC3Q5W041 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARMC3Q5W041 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARMC3Q5W041 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARMC3Q5W041 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARMC3Q5W041 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARMC3Q5W041 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARMC3Q5W041 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARMC3Q5W041 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARMC3Q5W041 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARMC3Q5W041 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ARMC3Q5W041 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARMC3Q5W041 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARMC3Q5W041 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARMC3Q5W041 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARMC3Q5W041 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARMC3Q5W041 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARMC3Q5W041 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARMC3Q5W041 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARMC3Q5W041 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARMC3Q5W041 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARMC3Q5W041 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARMC3Q5W041 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARMC3Q5W041 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARMC3Q5W041 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARMC3Q5W041 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARMC3Q5W041 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARMC3Q5W041 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARMC3Q5W041 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARMC3Q5W041 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ARMC3Q5W041 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARMC3Q5W041 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ARMC3Q5W041 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARMC3Q5W041 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARMC3Q5W041 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARMC3Q5W041 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARMC3Q5W041 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARMC3Q5W041 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARMC3Q5W041 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARMC3Q5W041 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARMC3Q5W041 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARMC3Q5W041 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARMC3Q5W041 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARMC3Q5W041 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARMC3Q5W041 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARMC3Q5W041 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARMC3Q5W041 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARMC3Q5W041 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms