Protein–RNA interactions for Protein: Q53HL2

CDCA8, Borealin, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA8Q53HL2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
CDCA8Q53HL2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
CDCA8Q53HL2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
CDCA8Q53HL2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC33.63■■■□□ 2.97
CDCA8Q53HL2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
CDCA8Q53HL2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
CDCA8Q53HL2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
CDCA8Q53HL2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
CDCA8Q53HL2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
CDCA8Q53HL2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
CDCA8Q53HL2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
CDCA8Q53HL2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
CDCA8Q53HL2 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
CDCA8Q53HL2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
CDCA8Q53HL2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
CDCA8Q53HL2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
CDCA8Q53HL2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
CDCA8Q53HL2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
CDCA8Q53HL2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
CDCA8Q53HL2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
CDCA8Q53HL2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
CDCA8Q53HL2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
CDCA8Q53HL2 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
CDCA8Q53HL2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
CDCA8Q53HL2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
CDCA8Q53HL2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
CDCA8Q53HL2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
CDCA8Q53HL2 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
CDCA8Q53HL2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
CDCA8Q53HL2 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
CDCA8Q53HL2 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
CDCA8Q53HL2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
CDCA8Q53HL2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
CDCA8Q53HL2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
CDCA8Q53HL2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
CDCA8Q53HL2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
CDCA8Q53HL2 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC33.58■■■□□ 2.97
CDCA8Q53HL2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
CDCA8Q53HL2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
CDCA8Q53HL2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
CDCA8Q53HL2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
CDCA8Q53HL2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
CDCA8Q53HL2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
CDCA8Q53HL2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC33.56■■■□□ 2.96
CDCA8Q53HL2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
CDCA8Q53HL2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
CDCA8Q53HL2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
CDCA8Q53HL2 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
CDCA8Q53HL2 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
CDCA8Q53HL2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
CDCA8Q53HL2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
CDCA8Q53HL2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
CDCA8Q53HL2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.54■■■□□ 2.96
CDCA8Q53HL2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
CDCA8Q53HL2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
CDCA8Q53HL2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
CDCA8Q53HL2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
CDCA8Q53HL2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
CDCA8Q53HL2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
CDCA8Q53HL2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
CDCA8Q53HL2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
CDCA8Q53HL2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
CDCA8Q53HL2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
CDCA8Q53HL2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
CDCA8Q53HL2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
CDCA8Q53HL2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
CDCA8Q53HL2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
CDCA8Q53HL2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
CDCA8Q53HL2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
CDCA8Q53HL2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
CDCA8Q53HL2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
CDCA8Q53HL2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
CDCA8Q53HL2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
CDCA8Q53HL2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
CDCA8Q53HL2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
CDCA8Q53HL2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
CDCA8Q53HL2 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
CDCA8Q53HL2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
CDCA8Q53HL2 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
CDCA8Q53HL2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
CDCA8Q53HL2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
CDCA8Q53HL2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
CDCA8Q53HL2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
CDCA8Q53HL2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
CDCA8Q53HL2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
CDCA8Q53HL2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
CDCA8Q53HL2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
CDCA8Q53HL2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
CDCA8Q53HL2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
CDCA8Q53HL2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
CDCA8Q53HL2 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
CDCA8Q53HL2 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
CDCA8Q53HL2 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
CDCA8Q53HL2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.94
CDCA8Q53HL2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.94
CDCA8Q53HL2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
CDCA8Q53HL2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
CDCA8Q53HL2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
CDCA8Q53HL2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
CDCA8Q53HL2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85 ms