Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZG55

GREB1, Protein GREB1, humanhuman

Predictions only

Length 1,949 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GREB1Q4ZG55 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GREB1Q4ZG55 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GREB1Q4ZG55 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GREB1Q4ZG55 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GREB1Q4ZG55 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GREB1Q4ZG55 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GREB1Q4ZG55 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GREB1Q4ZG55 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GREB1Q4ZG55 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GREB1Q4ZG55 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GREB1Q4ZG55 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GREB1Q4ZG55 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GREB1Q4ZG55 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GREB1Q4ZG55 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GREB1Q4ZG55 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
GREB1Q4ZG55 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
GREB1Q4ZG55 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
GREB1Q4ZG55 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
GREB1Q4ZG55 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
GREB1Q4ZG55 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
GREB1Q4ZG55 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GREB1Q4ZG55 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
GREB1Q4ZG55 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GREB1Q4ZG55 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GREB1Q4ZG55 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
GREB1Q4ZG55 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GREB1Q4ZG55 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GREB1Q4ZG55 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GREB1Q4ZG55 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GREB1Q4ZG55 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GREB1Q4ZG55 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GREB1Q4ZG55 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
GREB1Q4ZG55 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GREB1Q4ZG55 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GREB1Q4ZG55 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GREB1Q4ZG55 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GREB1Q4ZG55 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GREB1Q4ZG55 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GREB1Q4ZG55 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GREB1Q4ZG55 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
GREB1Q4ZG55 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GREB1Q4ZG55 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GREB1Q4ZG55 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GREB1Q4ZG55 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GREB1Q4ZG55 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GREB1Q4ZG55 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GREB1Q4ZG55 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GREB1Q4ZG55 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GREB1Q4ZG55 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GREB1Q4ZG55 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GREB1Q4ZG55 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GREB1Q4ZG55 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GREB1Q4ZG55 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GREB1Q4ZG55 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GREB1Q4ZG55 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GREB1Q4ZG55 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GREB1Q4ZG55 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GREB1Q4ZG55 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GREB1Q4ZG55 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GREB1Q4ZG55 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GREB1Q4ZG55 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GREB1Q4ZG55 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
GREB1Q4ZG55 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
GREB1Q4ZG55 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GREB1Q4ZG55 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GREB1Q4ZG55 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GREB1Q4ZG55 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GREB1Q4ZG55 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GREB1Q4ZG55 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GREB1Q4ZG55 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GREB1Q4ZG55 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GREB1Q4ZG55 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GREB1Q4ZG55 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GREB1Q4ZG55 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GREB1Q4ZG55 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
GREB1Q4ZG55 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GREB1Q4ZG55 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GREB1Q4ZG55 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GREB1Q4ZG55 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GREB1Q4ZG55 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GREB1Q4ZG55 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GREB1Q4ZG55 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
GREB1Q4ZG55 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GREB1Q4ZG55 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GREB1Q4ZG55 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GREB1Q4ZG55 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GREB1Q4ZG55 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GREB1Q4ZG55 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GREB1Q4ZG55 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GREB1Q4ZG55 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GREB1Q4ZG55 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GREB1Q4ZG55 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
GREB1Q4ZG55 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GREB1Q4ZG55 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GREB1Q4ZG55 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GREB1Q4ZG55 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
GREB1Q4ZG55 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GREB1Q4ZG55 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GREB1Q4ZG55 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GREB1Q4ZG55 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.8 ms