Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY05

LINC00303, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00303, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00303Q3SY05 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LINC00303Q3SY05 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LINC00303Q3SY05 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LINC00303Q3SY05 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LINC00303Q3SY05 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LINC00303Q3SY05 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LINC00303Q3SY05 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LINC00303Q3SY05 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LINC00303Q3SY05 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
LINC00303Q3SY05 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LINC00303Q3SY05 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LINC00303Q3SY05 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LINC00303Q3SY05 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LINC00303Q3SY05 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LINC00303Q3SY05 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LINC00303Q3SY05 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LINC00303Q3SY05 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LINC00303Q3SY05 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LINC00303Q3SY05 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LINC00303Q3SY05 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LINC00303Q3SY05 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LINC00303Q3SY05 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LINC00303Q3SY05 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LINC00303Q3SY05 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
LINC00303Q3SY05 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
LINC00303Q3SY05 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
LINC00303Q3SY05 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
LINC00303Q3SY05 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
LINC00303Q3SY05 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LINC00303Q3SY05 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LINC00303Q3SY05 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LINC00303Q3SY05 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LINC00303Q3SY05 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
LINC00303Q3SY05 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LINC00303Q3SY05 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LINC00303Q3SY05 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LINC00303Q3SY05 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LINC00303Q3SY05 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LINC00303Q3SY05 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LINC00303Q3SY05 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LINC00303Q3SY05 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LINC00303Q3SY05 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LINC00303Q3SY05 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LINC00303Q3SY05 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LINC00303Q3SY05 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LINC00303Q3SY05 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LINC00303Q3SY05 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LINC00303Q3SY05 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LINC00303Q3SY05 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LINC00303Q3SY05 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LINC00303Q3SY05 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LINC00303Q3SY05 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LINC00303Q3SY05 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LINC00303Q3SY05 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LINC00303Q3SY05 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LINC00303Q3SY05 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LINC00303Q3SY05 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
LINC00303Q3SY05 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LINC00303Q3SY05 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LINC00303Q3SY05 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
LINC00303Q3SY05 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
LINC00303Q3SY05 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LINC00303Q3SY05 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LINC00303Q3SY05 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LINC00303Q3SY05 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LINC00303Q3SY05 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LINC00303Q3SY05 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
LINC00303Q3SY05 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LINC00303Q3SY05 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LINC00303Q3SY05 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LINC00303Q3SY05 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LINC00303Q3SY05 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LINC00303Q3SY05 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LINC00303Q3SY05 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LINC00303Q3SY05 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LINC00303Q3SY05 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LINC00303Q3SY05 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LINC00303Q3SY05 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LINC00303Q3SY05 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LINC00303Q3SY05 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LINC00303Q3SY05 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
LINC00303Q3SY05 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LINC00303Q3SY05 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LINC00303Q3SY05 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LINC00303Q3SY05 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LINC00303Q3SY05 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LINC00303Q3SY05 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LINC00303Q3SY05 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
LINC00303Q3SY05 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LINC00303Q3SY05 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LINC00303Q3SY05 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
LINC00303Q3SY05 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LINC00303Q3SY05 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LINC00303Q3SY05 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LINC00303Q3SY05 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LINC00303Q3SY05 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LINC00303Q3SY05 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LINC00303Q3SY05 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LINC00303Q3SY05 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
LINC00303Q3SY05 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms