Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
ATP2B3Q16720 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
ATP2B3Q16720 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
ATP2B3Q16720 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
ATP2B3Q16720 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
ATP2B3Q16720 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
ATP2B3Q16720 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
ATP2B3Q16720 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
ATP2B3Q16720 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ATP2B3Q16720 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ATP2B3Q16720 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ATP2B3Q16720 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
ATP2B3Q16720 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.35
ATP2B3Q16720 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
ATP2B3Q16720 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
ATP2B3Q16720 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
ATP2B3Q16720 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
ATP2B3Q16720 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
ATP2B3Q16720 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
ATP2B3Q16720 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
ATP2B3Q16720 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
ATP2B3Q16720 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
ATP2B3Q16720 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
ATP2B3Q16720 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
ATP2B3Q16720 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
ATP2B3Q16720 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
ATP2B3Q16720 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
ATP2B3Q16720 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
ATP2B3Q16720 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
ATP2B3Q16720 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
ATP2B3Q16720 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
ATP2B3Q16720 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
ATP2B3Q16720 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
ATP2B3Q16720 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ATP2B3Q16720 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ATP2B3Q16720 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ATP2B3Q16720 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
ATP2B3Q16720 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ATP2B3Q16720 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
ATP2B3Q16720 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ATP2B3Q16720 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ATP2B3Q16720 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ATP2B3Q16720 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
ATP2B3Q16720 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
ATP2B3Q16720 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
ATP2B3Q16720 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
ATP2B3Q16720 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
ATP2B3Q16720 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
ATP2B3Q16720 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
ATP2B3Q16720 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
ATP2B3Q16720 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
ATP2B3Q16720 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
ATP2B3Q16720 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
ATP2B3Q16720 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
ATP2B3Q16720 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
ATP2B3Q16720 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
ATP2B3Q16720 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
ATP2B3Q16720 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
ATP2B3Q16720 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ATP2B3Q16720 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
ATP2B3Q16720 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ATP2B3Q16720 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
ATP2B3Q16720 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
ATP2B3Q16720 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
ATP2B3Q16720 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ATP2B3Q16720 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
ATP2B3Q16720 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
ATP2B3Q16720 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
ATP2B3Q16720 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
ATP2B3Q16720 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
ATP2B3Q16720 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
ATP2B3Q16720 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
ATP2B3Q16720 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
ATP2B3Q16720 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
ATP2B3Q16720 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
ATP2B3Q16720 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
ATP2B3Q16720 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
ATP2B3Q16720 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
ATP2B3Q16720 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
ATP2B3Q16720 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
ATP2B3Q16720 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ATP2B3Q16720 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
ATP2B3Q16720 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ATP2B3Q16720 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ATP2B3Q16720 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
ATP2B3Q16720 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
ATP2B3Q16720 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
ATP2B3Q16720 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ATP2B3Q16720 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ATP2B3Q16720 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ATP2B3Q16720 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ATP2B3Q16720 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ATP2B3Q16720 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
ATP2B3Q16720 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ATP2B3Q16720 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ATP2B3Q16720 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ATP2B3Q16720 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ATP2B3Q16720 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ATP2B3Q16720 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ATP2B3Q16720 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
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