Protein–RNA interactions for Protein: Q15643

TRIP11, Thyroid receptor-interacting protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP11Q15643 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRIP11Q15643 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRIP11Q15643 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRIP11Q15643 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
TRIP11Q15643 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
TRIP11Q15643 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRIP11Q15643 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRIP11Q15643 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRIP11Q15643 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRIP11Q15643 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRIP11Q15643 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRIP11Q15643 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRIP11Q15643 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRIP11Q15643 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRIP11Q15643 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRIP11Q15643 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRIP11Q15643 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRIP11Q15643 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRIP11Q15643 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRIP11Q15643 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRIP11Q15643 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRIP11Q15643 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRIP11Q15643 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRIP11Q15643 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRIP11Q15643 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
TRIP11Q15643 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRIP11Q15643 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRIP11Q15643 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRIP11Q15643 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRIP11Q15643 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRIP11Q15643 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRIP11Q15643 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRIP11Q15643 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRIP11Q15643 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRIP11Q15643 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRIP11Q15643 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRIP11Q15643 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
TRIP11Q15643 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRIP11Q15643 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TRIP11Q15643 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TRIP11Q15643 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TRIP11Q15643 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
TRIP11Q15643 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TRIP11Q15643 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TRIP11Q15643 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TRIP11Q15643 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRIP11Q15643 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRIP11Q15643 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRIP11Q15643 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRIP11Q15643 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRIP11Q15643 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRIP11Q15643 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRIP11Q15643 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRIP11Q15643 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRIP11Q15643 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRIP11Q15643 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRIP11Q15643 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
TRIP11Q15643 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRIP11Q15643 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRIP11Q15643 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
TRIP11Q15643 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRIP11Q15643 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
TRIP11Q15643 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRIP11Q15643 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRIP11Q15643 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRIP11Q15643 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRIP11Q15643 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRIP11Q15643 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRIP11Q15643 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRIP11Q15643 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TRIP11Q15643 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
TRIP11Q15643 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TRIP11Q15643 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TRIP11Q15643 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TRIP11Q15643 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TRIP11Q15643 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIP11Q15643 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIP11Q15643 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIP11Q15643 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIP11Q15643 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIP11Q15643 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIP11Q15643 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIP11Q15643 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIP11Q15643 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIP11Q15643 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIP11Q15643 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIP11Q15643 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIP11Q15643 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIP11Q15643 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIP11Q15643 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIP11Q15643 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIP11Q15643 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIP11Q15643 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIP11Q15643 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIP11Q15643 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIP11Q15643 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIP11Q15643 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIP11Q15643 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIP11Q15643 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIP11Q15643 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms