Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

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Length 451 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IRF4Q15306 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IRF4Q15306 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IRF4Q15306 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IRF4Q15306 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IRF4Q15306 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IRF4Q15306 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IRF4Q15306 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IRF4Q15306 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IRF4Q15306 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IRF4Q15306 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IRF4Q15306 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IRF4Q15306 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IRF4Q15306 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IRF4Q15306 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IRF4Q15306 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IRF4Q15306 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
IRF4Q15306 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IRF4Q15306 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IRF4Q15306 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IRF4Q15306 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
IRF4Q15306 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IRF4Q15306 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IRF4Q15306 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IRF4Q15306 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IRF4Q15306 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
IRF4Q15306 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IRF4Q15306 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
IRF4Q15306 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
IRF4Q15306 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IRF4Q15306 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IRF4Q15306 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
IRF4Q15306 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
IRF4Q15306 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
IRF4Q15306 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24■■□□□ 1.43
IRF4Q15306 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
IRF4Q15306 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IRF4Q15306 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IRF4Q15306 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IRF4Q15306 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IRF4Q15306 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IRF4Q15306 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
IRF4Q15306 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
IRF4Q15306 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
IRF4Q15306 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
IRF4Q15306 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
IRF4Q15306 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
IRF4Q15306 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
IRF4Q15306 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
IRF4Q15306 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
IRF4Q15306 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
IRF4Q15306 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
IRF4Q15306 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
IRF4Q15306 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
IRF4Q15306 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
IRF4Q15306 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
IRF4Q15306 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
IRF4Q15306 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
IRF4Q15306 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
IRF4Q15306 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
IRF4Q15306 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IRF4Q15306 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IRF4Q15306 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IRF4Q15306 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IRF4Q15306 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IRF4Q15306 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
IRF4Q15306 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
IRF4Q15306 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
IRF4Q15306 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
IRF4Q15306 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
IRF4Q15306 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IRF4Q15306 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IRF4Q15306 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IRF4Q15306 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
IRF4Q15306 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
IRF4Q15306 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
IRF4Q15306 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
IRF4Q15306 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IRF4Q15306 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
IRF4Q15306 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
IRF4Q15306 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IRF4Q15306 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IRF4Q15306 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
IRF4Q15306 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IRF4Q15306 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IRF4Q15306 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IRF4Q15306 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IRF4Q15306 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
IRF4Q15306 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
IRF4Q15306 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
IRF4Q15306 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IRF4Q15306 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
IRF4Q15306 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IRF4Q15306 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
IRF4Q15306 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IRF4Q15306 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
IRF4Q15306 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
IRF4Q15306 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
IRF4Q15306 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
IRF4Q15306 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
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