Protein–RNA interactions for Protein: Q15036

SNX17, Sorting nexin-17, humanhuman

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Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX17Q15036 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SNX17Q15036 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
SNX17Q15036 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SNX17Q15036 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SNX17Q15036 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SNX17Q15036 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SNX17Q15036 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SNX17Q15036 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SNX17Q15036 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SNX17Q15036 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SNX17Q15036 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
SNX17Q15036 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SNX17Q15036 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SNX17Q15036 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SNX17Q15036 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SNX17Q15036 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SNX17Q15036 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SNX17Q15036 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SNX17Q15036 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SNX17Q15036 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SNX17Q15036 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SNX17Q15036 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SNX17Q15036 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SNX17Q15036 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SNX17Q15036 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SNX17Q15036 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SNX17Q15036 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SNX17Q15036 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SNX17Q15036 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
SNX17Q15036 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SNX17Q15036 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SNX17Q15036 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SNX17Q15036 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SNX17Q15036 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SNX17Q15036 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SNX17Q15036 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SNX17Q15036 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SNX17Q15036 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
SNX17Q15036 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SNX17Q15036 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SNX17Q15036 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SNX17Q15036 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
SNX17Q15036 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
SNX17Q15036 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SNX17Q15036 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
SNX17Q15036 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SNX17Q15036 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SNX17Q15036 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SNX17Q15036 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SNX17Q15036 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SNX17Q15036 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SNX17Q15036 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SNX17Q15036 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SNX17Q15036 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SNX17Q15036 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SNX17Q15036 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SNX17Q15036 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SNX17Q15036 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SNX17Q15036 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SNX17Q15036 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SNX17Q15036 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
SNX17Q15036 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
SNX17Q15036 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SNX17Q15036 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SNX17Q15036 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SNX17Q15036 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SNX17Q15036 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SNX17Q15036 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
SNX17Q15036 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SNX17Q15036 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SNX17Q15036 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SNX17Q15036 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SNX17Q15036 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SNX17Q15036 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SNX17Q15036 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SNX17Q15036 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SNX17Q15036 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SNX17Q15036 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
SNX17Q15036 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SNX17Q15036 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SNX17Q15036 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SNX17Q15036 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SNX17Q15036 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SNX17Q15036 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
SNX17Q15036 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SNX17Q15036 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SNX17Q15036 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SNX17Q15036 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SNX17Q15036 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SNX17Q15036 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SNX17Q15036 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SNX17Q15036 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SNX17Q15036 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SNX17Q15036 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SNX17Q15036 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SNX17Q15036 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SNX17Q15036 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SNX17Q15036 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SNX17Q15036 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SNX17Q15036 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
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