Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

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Length 502 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
NFIXQ14938 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
NFIXQ14938 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
NFIXQ14938 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
NFIXQ14938 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
NFIXQ14938 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
NFIXQ14938 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
NFIXQ14938 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
NFIXQ14938 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
NFIXQ14938 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
NFIXQ14938 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
NFIXQ14938 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC30.7■■■□□ 2.51
NFIXQ14938 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
NFIXQ14938 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
NFIXQ14938 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
NFIXQ14938 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
NFIXQ14938 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
NFIXQ14938 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
NFIXQ14938 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC30.69■■■□□ 2.5
NFIXQ14938 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
NFIXQ14938 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
NFIXQ14938 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
NFIXQ14938 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
NFIXQ14938 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC30.68■■■□□ 2.5
NFIXQ14938 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.68■■■□□ 2.5
NFIXQ14938 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
NFIXQ14938 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
NFIXQ14938 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
NFIXQ14938 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
NFIXQ14938 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
NFIXQ14938 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
NFIXQ14938 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
NFIXQ14938 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
NFIXQ14938 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
NFIXQ14938 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
NFIXQ14938 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
NFIXQ14938 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC30.65■■■□□ 2.5
NFIXQ14938 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
NFIXQ14938 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
NFIXQ14938 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
NFIXQ14938 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
NFIXQ14938 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
NFIXQ14938 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC30.63■■■□□ 2.49
NFIXQ14938 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
NFIXQ14938 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
NFIXQ14938 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
NFIXQ14938 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
NFIXQ14938 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
NFIXQ14938 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
NFIXQ14938 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
NFIXQ14938 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
NFIXQ14938 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
NFIXQ14938 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
NFIXQ14938 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
NFIXQ14938 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
NFIXQ14938 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
NFIXQ14938 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
NFIXQ14938 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
NFIXQ14938 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
NFIXQ14938 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
NFIXQ14938 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
NFIXQ14938 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
NFIXQ14938 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
NFIXQ14938 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
NFIXQ14938 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
NFIXQ14938 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
NFIXQ14938 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
NFIXQ14938 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.49
NFIXQ14938 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
NFIXQ14938 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
NFIXQ14938 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
NFIXQ14938 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
NFIXQ14938 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
NFIXQ14938 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
NFIXQ14938 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
NFIXQ14938 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
NFIXQ14938 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
NFIXQ14938 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
NFIXQ14938 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
NFIXQ14938 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
NFIXQ14938 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
NFIXQ14938 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
NFIXQ14938 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
NFIXQ14938 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
NFIXQ14938 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
NFIXQ14938 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
NFIXQ14938 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
NFIXQ14938 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
NFIXQ14938 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
NFIXQ14938 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
NFIXQ14938 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
NFIXQ14938 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
NFIXQ14938 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
NFIXQ14938 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
NFIXQ14938 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
NFIXQ14938 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
NFIXQ14938 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
NFIXQ14938 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
NFIXQ14938 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
NFIXQ14938 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
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