Protein–RNA interactions for Protein: Q14781

CBX2, Chromobox protein homolog 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX2Q14781 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CBX2Q14781 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CBX2Q14781 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CBX2Q14781 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CBX2Q14781 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CBX2Q14781 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CBX2Q14781 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CBX2Q14781 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CBX2Q14781 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CBX2Q14781 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CBX2Q14781 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CBX2Q14781 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CBX2Q14781 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CBX2Q14781 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CBX2Q14781 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CBX2Q14781 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CBX2Q14781 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CBX2Q14781 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CBX2Q14781 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CBX2Q14781 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CBX2Q14781 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CBX2Q14781 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CBX2Q14781 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CBX2Q14781 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CBX2Q14781 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CBX2Q14781 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CBX2Q14781 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CBX2Q14781 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CBX2Q14781 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CBX2Q14781 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CBX2Q14781 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CBX2Q14781 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CBX2Q14781 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CBX2Q14781 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CBX2Q14781 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CBX2Q14781 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CBX2Q14781 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CBX2Q14781 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CBX2Q14781 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CBX2Q14781 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CBX2Q14781 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CBX2Q14781 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CBX2Q14781 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CBX2Q14781 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CBX2Q14781 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CBX2Q14781 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CBX2Q14781 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CBX2Q14781 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CBX2Q14781 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CBX2Q14781 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CBX2Q14781 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CBX2Q14781 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CBX2Q14781 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CBX2Q14781 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
CBX2Q14781 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CBX2Q14781 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CBX2Q14781 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CBX2Q14781 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CBX2Q14781 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CBX2Q14781 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CBX2Q14781 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CBX2Q14781 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CBX2Q14781 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CBX2Q14781 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CBX2Q14781 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CBX2Q14781 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CBX2Q14781 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CBX2Q14781 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CBX2Q14781 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CBX2Q14781 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CBX2Q14781 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CBX2Q14781 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CBX2Q14781 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CBX2Q14781 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CBX2Q14781 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CBX2Q14781 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CBX2Q14781 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CBX2Q14781 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CBX2Q14781 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CBX2Q14781 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CBX2Q14781 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CBX2Q14781 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CBX2Q14781 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CBX2Q14781 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CBX2Q14781 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CBX2Q14781 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CBX2Q14781 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CBX2Q14781 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CBX2Q14781 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CBX2Q14781 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CBX2Q14781 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CBX2Q14781 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CBX2Q14781 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CBX2Q14781 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CBX2Q14781 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CBX2Q14781 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CBX2Q14781 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CBX2Q14781 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CBX2Q14781 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CBX2Q14781 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms