Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SCARF1Q14162 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SCARF1Q14162 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
SCARF1Q14162 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
SCARF1Q14162 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SCARF1Q14162 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SCARF1Q14162 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SCARF1Q14162 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SCARF1Q14162 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SCARF1Q14162 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SCARF1Q14162 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SCARF1Q14162 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SCARF1Q14162 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SCARF1Q14162 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SCARF1Q14162 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SCARF1Q14162 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SCARF1Q14162 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SCARF1Q14162 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SCARF1Q14162 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SCARF1Q14162 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
SCARF1Q14162 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SCARF1Q14162 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SCARF1Q14162 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SCARF1Q14162 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
SCARF1Q14162 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SCARF1Q14162 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SCARF1Q14162 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
SCARF1Q14162 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
SCARF1Q14162 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
SCARF1Q14162 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SCARF1Q14162 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
SCARF1Q14162 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SCARF1Q14162 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SCARF1Q14162 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SCARF1Q14162 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SCARF1Q14162 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SCARF1Q14162 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SCARF1Q14162 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SCARF1Q14162 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SCARF1Q14162 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SCARF1Q14162 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
SCARF1Q14162 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SCARF1Q14162 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.36
SCARF1Q14162 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.36
SCARF1Q14162 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SCARF1Q14162 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SCARF1Q14162 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SCARF1Q14162 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SCARF1Q14162 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SCARF1Q14162 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SCARF1Q14162 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SCARF1Q14162 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SCARF1Q14162 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SCARF1Q14162 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SCARF1Q14162 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SCARF1Q14162 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SCARF1Q14162 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SCARF1Q14162 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SCARF1Q14162 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SCARF1Q14162 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SCARF1Q14162 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SCARF1Q14162 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SCARF1Q14162 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SCARF1Q14162 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SCARF1Q14162 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SCARF1Q14162 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SCARF1Q14162 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SCARF1Q14162 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SCARF1Q14162 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SCARF1Q14162 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SCARF1Q14162 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SCARF1Q14162 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
SCARF1Q14162 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SCARF1Q14162 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SCARF1Q14162 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SCARF1Q14162 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SCARF1Q14162 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
SCARF1Q14162 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SCARF1Q14162 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SCARF1Q14162 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SCARF1Q14162 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SCARF1Q14162 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SCARF1Q14162 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SCARF1Q14162 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SCARF1Q14162 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SCARF1Q14162 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SCARF1Q14162 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SCARF1Q14162 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SCARF1Q14162 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SCARF1Q14162 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SCARF1Q14162 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SCARF1Q14162 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SCARF1Q14162 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SCARF1Q14162 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SCARF1Q14162 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
SCARF1Q14162 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SCARF1Q14162 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SCARF1Q14162 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SCARF1Q14162 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SCARF1Q14162 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
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