Protein–RNA interactions for Protein: Q13613

MTMR1, Myotubularin-related protein 1, humanhuman

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Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR1Q13613 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MTMR1Q13613 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MTMR1Q13613 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MTMR1Q13613 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MTMR1Q13613 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
MTMR1Q13613 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
MTMR1Q13613 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
MTMR1Q13613 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MTMR1Q13613 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MTMR1Q13613 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MTMR1Q13613 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MTMR1Q13613 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
MTMR1Q13613 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
MTMR1Q13613 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MTMR1Q13613 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MTMR1Q13613 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MTMR1Q13613 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
MTMR1Q13613 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MTMR1Q13613 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MTMR1Q13613 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MTMR1Q13613 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MTMR1Q13613 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MTMR1Q13613 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MTMR1Q13613 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MTMR1Q13613 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MTMR1Q13613 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MTMR1Q13613 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MTMR1Q13613 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MTMR1Q13613 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MTMR1Q13613 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
MTMR1Q13613 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
MTMR1Q13613 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MTMR1Q13613 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MTMR1Q13613 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MTMR1Q13613 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MTMR1Q13613 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MTMR1Q13613 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MTMR1Q13613 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MTMR1Q13613 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MTMR1Q13613 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MTMR1Q13613 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
MTMR1Q13613 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MTMR1Q13613 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MTMR1Q13613 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MTMR1Q13613 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MTMR1Q13613 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MTMR1Q13613 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
MTMR1Q13613 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
MTMR1Q13613 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
MTMR1Q13613 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MTMR1Q13613 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
MTMR1Q13613 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MTMR1Q13613 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MTMR1Q13613 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MTMR1Q13613 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MTMR1Q13613 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MTMR1Q13613 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MTMR1Q13613 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MTMR1Q13613 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MTMR1Q13613 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MTMR1Q13613 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MTMR1Q13613 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MTMR1Q13613 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MTMR1Q13613 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
MTMR1Q13613 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MTMR1Q13613 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MTMR1Q13613 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MTMR1Q13613 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MTMR1Q13613 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
MTMR1Q13613 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MTMR1Q13613 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MTMR1Q13613 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MTMR1Q13613 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MTMR1Q13613 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MTMR1Q13613 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MTMR1Q13613 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MTMR1Q13613 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
MTMR1Q13613 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MTMR1Q13613 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MTMR1Q13613 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MTMR1Q13613 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MTMR1Q13613 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MTMR1Q13613 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MTMR1Q13613 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MTMR1Q13613 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MTMR1Q13613 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MTMR1Q13613 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MTMR1Q13613 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MTMR1Q13613 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
MTMR1Q13613 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MTMR1Q13613 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MTMR1Q13613 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MTMR1Q13613 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MTMR1Q13613 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MTMR1Q13613 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
MTMR1Q13613 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MTMR1Q13613 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MTMR1Q13613 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MTMR1Q13613 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MTMR1Q13613 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
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