Protein–RNA interactions for Protein: Q13308

PTK7, Inactive tyrosine-protein kinase 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTK7Q13308 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PTK7Q13308 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PTK7Q13308 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PTK7Q13308 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PTK7Q13308 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PTK7Q13308 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PTK7Q13308 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
PTK7Q13308 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PTK7Q13308 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTK7Q13308 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTK7Q13308 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTK7Q13308 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTK7Q13308 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
PTK7Q13308 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTK7Q13308 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTK7Q13308 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTK7Q13308 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTK7Q13308 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTK7Q13308 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTK7Q13308 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTK7Q13308 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTK7Q13308 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTK7Q13308 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTK7Q13308 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTK7Q13308 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTK7Q13308 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTK7Q13308 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTK7Q13308 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTK7Q13308 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTK7Q13308 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTK7Q13308 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTK7Q13308 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTK7Q13308 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTK7Q13308 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
PTK7Q13308 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTK7Q13308 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTK7Q13308 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTK7Q13308 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTK7Q13308 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTK7Q13308 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTK7Q13308 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
PTK7Q13308 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTK7Q13308 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTK7Q13308 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTK7Q13308 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTK7Q13308 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTK7Q13308 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTK7Q13308 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTK7Q13308 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
PTK7Q13308 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
PTK7Q13308 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTK7Q13308 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTK7Q13308 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
PTK7Q13308 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTK7Q13308 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTK7Q13308 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTK7Q13308 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
PTK7Q13308 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTK7Q13308 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTK7Q13308 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTK7Q13308 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTK7Q13308 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTK7Q13308 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTK7Q13308 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTK7Q13308 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTK7Q13308 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTK7Q13308 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTK7Q13308 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTK7Q13308 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTK7Q13308 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTK7Q13308 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTK7Q13308 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTK7Q13308 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTK7Q13308 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTK7Q13308 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTK7Q13308 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTK7Q13308 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTK7Q13308 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTK7Q13308 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTK7Q13308 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTK7Q13308 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTK7Q13308 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PTK7Q13308 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTK7Q13308 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTK7Q13308 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTK7Q13308 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTK7Q13308 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTK7Q13308 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTK7Q13308 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTK7Q13308 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
PTK7Q13308 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTK7Q13308 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTK7Q13308 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTK7Q13308 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTK7Q13308 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTK7Q13308 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTK7Q13308 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTK7Q13308 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PTK7Q13308 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PTK7Q13308 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.6 ms