Protein–RNA interactions for Protein: Q13308

PTK7, Inactive tyrosine-protein kinase 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTK7Q13308 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC38.33■■■■□ 3.73
PTK7Q13308 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC37.78■■■■□ 3.64
PTK7Q13308 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
PTK7Q13308 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.2■■■■□ 3.55
PTK7Q13308 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
PTK7Q13308 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.9■■■■□ 3.5
PTK7Q13308 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
PTK7Q13308 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC36.65■■■■□ 3.46
PTK7Q13308 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
PTK7Q13308 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC36.01■■■■□ 3.36
PTK7Q13308 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.35
PTK7Q13308 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC35.88■■■■□ 3.33
PTK7Q13308 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
PTK7Q13308 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
PTK7Q13308 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
PTK7Q13308 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
PTK7Q13308 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
PTK7Q13308 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
PTK7Q13308 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
PTK7Q13308 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
PTK7Q13308 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
PTK7Q13308 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
PTK7Q13308 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
PTK7Q13308 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
PTK7Q13308 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
PTK7Q13308 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
PTK7Q13308 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC34.94■■■■□ 3.18
PTK7Q13308 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
PTK7Q13308 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
PTK7Q13308 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
PTK7Q13308 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
PTK7Q13308 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
PTK7Q13308 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
PTK7Q13308 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
PTK7Q13308 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC34.29■■■■□ 3.08
PTK7Q13308 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
PTK7Q13308 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC34.26■■■■□ 3.08
PTK7Q13308 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
PTK7Q13308 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
PTK7Q13308 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
PTK7Q13308 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.02
PTK7Q13308 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
PTK7Q13308 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
PTK7Q13308 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
PTK7Q13308 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
PTK7Q13308 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
PTK7Q13308 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
PTK7Q13308 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
PTK7Q13308 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
PTK7Q13308 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
PTK7Q13308 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
PTK7Q13308 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
PTK7Q13308 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
PTK7Q13308 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
PTK7Q13308 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC33.27■■■□□ 2.92
PTK7Q13308 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC33.26■■■□□ 2.91
PTK7Q13308 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
PTK7Q13308 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
PTK7Q13308 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
PTK7Q13308 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
PTK7Q13308 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
PTK7Q13308 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
PTK7Q13308 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
PTK7Q13308 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
PTK7Q13308 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
PTK7Q13308 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
PTK7Q13308 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
PTK7Q13308 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
PTK7Q13308 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
PTK7Q13308 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
PTK7Q13308 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
PTK7Q13308 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC32.98■■■□□ 2.87
PTK7Q13308 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
PTK7Q13308 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC32.96■■■□□ 2.87
PTK7Q13308 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
PTK7Q13308 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC32.95■■■□□ 2.87
PTK7Q13308 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC32.95■■■□□ 2.86
PTK7Q13308 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
PTK7Q13308 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
PTK7Q13308 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
PTK7Q13308 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
PTK7Q13308 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
PTK7Q13308 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
PTK7Q13308 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
PTK7Q13308 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
PTK7Q13308 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
PTK7Q13308 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
PTK7Q13308 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
PTK7Q13308 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
PTK7Q13308 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.7■■■□□ 2.83
PTK7Q13308 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
PTK7Q13308 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
PTK7Q13308 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
PTK7Q13308 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
PTK7Q13308 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
PTK7Q13308 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
PTK7Q13308 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
PTK7Q13308 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
PTK7Q13308 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
PTK7Q13308 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
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