Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SRSF5Q13243 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SRSF5Q13243 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SRSF5Q13243 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SRSF5Q13243 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SRSF5Q13243 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SRSF5Q13243 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SRSF5Q13243 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SRSF5Q13243 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SRSF5Q13243 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SRSF5Q13243 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SRSF5Q13243 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SRSF5Q13243 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SRSF5Q13243 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SRSF5Q13243 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SRSF5Q13243 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SRSF5Q13243 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SRSF5Q13243 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SRSF5Q13243 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SRSF5Q13243 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SRSF5Q13243 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SRSF5Q13243 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SRSF5Q13243 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SRSF5Q13243 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SRSF5Q13243 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SRSF5Q13243 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SRSF5Q13243 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SRSF5Q13243 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SRSF5Q13243 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SRSF5Q13243 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SRSF5Q13243 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SRSF5Q13243 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SRSF5Q13243 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SRSF5Q13243 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SRSF5Q13243 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SRSF5Q13243 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SRSF5Q13243 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SRSF5Q13243 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SRSF5Q13243 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SRSF5Q13243 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SRSF5Q13243 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SRSF5Q13243 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SRSF5Q13243 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SRSF5Q13243 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SRSF5Q13243 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SRSF5Q13243 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SRSF5Q13243 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SRSF5Q13243 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SRSF5Q13243 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SRSF5Q13243 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SRSF5Q13243 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SRSF5Q13243 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SRSF5Q13243 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SRSF5Q13243 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SRSF5Q13243 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SRSF5Q13243 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SRSF5Q13243 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SRSF5Q13243 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SRSF5Q13243 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SRSF5Q13243 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SRSF5Q13243 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SRSF5Q13243 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SRSF5Q13243 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SRSF5Q13243 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SRSF5Q13243 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SRSF5Q13243 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SRSF5Q13243 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SRSF5Q13243 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SRSF5Q13243 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SRSF5Q13243 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SRSF5Q13243 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SRSF5Q13243 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SRSF5Q13243 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SRSF5Q13243 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SRSF5Q13243 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SRSF5Q13243 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SRSF5Q13243 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SRSF5Q13243 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SRSF5Q13243 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SRSF5Q13243 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SRSF5Q13243 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SRSF5Q13243 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SRSF5Q13243 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SRSF5Q13243 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SRSF5Q13243 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SRSF5Q13243 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SRSF5Q13243 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SRSF5Q13243 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SRSF5Q13243 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SRSF5Q13243 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SRSF5Q13243 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SRSF5Q13243 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SRSF5Q13243 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SRSF5Q13243 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SRSF5Q13243 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SRSF5Q13243 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SRSF5Q13243 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SRSF5Q13243 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SRSF5Q13243 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SRSF5Q13243 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
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