Protein–RNA interactions for Protein: Q13136

PPFIA1, Liprin-alpha-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA1Q13136 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PPFIA1Q13136 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PPFIA1Q13136 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PPFIA1Q13136 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PPFIA1Q13136 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PPFIA1Q13136 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PPFIA1Q13136 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PPFIA1Q13136 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PPFIA1Q13136 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PPFIA1Q13136 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PPFIA1Q13136 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PPFIA1Q13136 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
PPFIA1Q13136 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PPFIA1Q13136 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PPFIA1Q13136 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PPFIA1Q13136 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PPFIA1Q13136 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
PPFIA1Q13136 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PPFIA1Q13136 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PPFIA1Q13136 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PPFIA1Q13136 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PPFIA1Q13136 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PPFIA1Q13136 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PPFIA1Q13136 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PPFIA1Q13136 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PPFIA1Q13136 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PPFIA1Q13136 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PPFIA1Q13136 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PPFIA1Q13136 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PPFIA1Q13136 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PPFIA1Q13136 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PPFIA1Q13136 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PPFIA1Q13136 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PPFIA1Q13136 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PPFIA1Q13136 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PPFIA1Q13136 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
PPFIA1Q13136 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
PPFIA1Q13136 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PPFIA1Q13136 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PPFIA1Q13136 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PPFIA1Q13136 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PPFIA1Q13136 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PPFIA1Q13136 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PPFIA1Q13136 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PPFIA1Q13136 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PPFIA1Q13136 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PPFIA1Q13136 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PPFIA1Q13136 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PPFIA1Q13136 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PPFIA1Q13136 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PPFIA1Q13136 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PPFIA1Q13136 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PPFIA1Q13136 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PPFIA1Q13136 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
PPFIA1Q13136 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PPFIA1Q13136 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PPFIA1Q13136 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PPFIA1Q13136 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PPFIA1Q13136 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PPFIA1Q13136 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PPFIA1Q13136 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PPFIA1Q13136 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PPFIA1Q13136 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PPFIA1Q13136 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
PPFIA1Q13136 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
PPFIA1Q13136 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PPFIA1Q13136 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PPFIA1Q13136 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
PPFIA1Q13136 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PPFIA1Q13136 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PPFIA1Q13136 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PPFIA1Q13136 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PPFIA1Q13136 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PPFIA1Q13136 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PPFIA1Q13136 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PPFIA1Q13136 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PPFIA1Q13136 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PPFIA1Q13136 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PPFIA1Q13136 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PPFIA1Q13136 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PPFIA1Q13136 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PPFIA1Q13136 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PPFIA1Q13136 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PPFIA1Q13136 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PPFIA1Q13136 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PPFIA1Q13136 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PPFIA1Q13136 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PPFIA1Q13136 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PPFIA1Q13136 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PPFIA1Q13136 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PPFIA1Q13136 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PPFIA1Q13136 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PPFIA1Q13136 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PPFIA1Q13136 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PPFIA1Q13136 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PPFIA1Q13136 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PPFIA1Q13136 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
PPFIA1Q13136 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PPFIA1Q13136 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PPFIA1Q13136 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
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