Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GRIK3Q13003 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GRIK3Q13003 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GRIK3Q13003 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GRIK3Q13003 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GRIK3Q13003 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GRIK3Q13003 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GRIK3Q13003 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
GRIK3Q13003 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GRIK3Q13003 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
GRIK3Q13003 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GRIK3Q13003 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GRIK3Q13003 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GRIK3Q13003 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GRIK3Q13003 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GRIK3Q13003 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GRIK3Q13003 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GRIK3Q13003 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GRIK3Q13003 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GRIK3Q13003 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GRIK3Q13003 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GRIK3Q13003 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GRIK3Q13003 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GRIK3Q13003 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GRIK3Q13003 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GRIK3Q13003 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GRIK3Q13003 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GRIK3Q13003 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GRIK3Q13003 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GRIK3Q13003 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GRIK3Q13003 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GRIK3Q13003 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
GRIK3Q13003 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
GRIK3Q13003 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GRIK3Q13003 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GRIK3Q13003 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GRIK3Q13003 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GRIK3Q13003 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GRIK3Q13003 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GRIK3Q13003 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GRIK3Q13003 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
GRIK3Q13003 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GRIK3Q13003 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
GRIK3Q13003 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GRIK3Q13003 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GRIK3Q13003 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GRIK3Q13003 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GRIK3Q13003 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
GRIK3Q13003 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GRIK3Q13003 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GRIK3Q13003 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GRIK3Q13003 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GRIK3Q13003 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GRIK3Q13003 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GRIK3Q13003 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GRIK3Q13003 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GRIK3Q13003 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GRIK3Q13003 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GRIK3Q13003 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GRIK3Q13003 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GRIK3Q13003 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
GRIK3Q13003 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
GRIK3Q13003 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GRIK3Q13003 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
GRIK3Q13003 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GRIK3Q13003 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GRIK3Q13003 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GRIK3Q13003 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GRIK3Q13003 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GRIK3Q13003 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GRIK3Q13003 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GRIK3Q13003 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GRIK3Q13003 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GRIK3Q13003 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
GRIK3Q13003 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GRIK3Q13003 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
GRIK3Q13003 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GRIK3Q13003 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GRIK3Q13003 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GRIK3Q13003 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GRIK3Q13003 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GRIK3Q13003 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GRIK3Q13003 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
GRIK3Q13003 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GRIK3Q13003 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GRIK3Q13003 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GRIK3Q13003 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GRIK3Q13003 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GRIK3Q13003 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GRIK3Q13003 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GRIK3Q13003 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GRIK3Q13003 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GRIK3Q13003 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GRIK3Q13003 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GRIK3Q13003 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GRIK3Q13003 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GRIK3Q13003 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
GRIK3Q13003 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GRIK3Q13003 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GRIK3Q13003 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
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