Protein–RNA interactions for Protein: Q12849

GRSF1, G-rich sequence factor 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRSF1Q12849 NOP53-205ENST00000597985 656 ntTSL 316.1■□□□□ 0.179e-8■■■□□ 15.6
GRSF1Q12849 NOP53-208ENST00000598959 501 ntTSL 511.22□□□□□ -0.619e-8■■■□□ 15.6
GRSF1Q12849 AL355987.2-201ENST00000471502 561 ntTSL 4 BASIC13.23□□□□□ -0.297e-9■■■□□ 15.6
GRSF1Q12849 MBD3-211ENST00000592965 568 ntTSL 424.77■■□□□ 1.563e-15■■■□□ 15.6
GRSF1Q12849 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.223e-15■■■□□ 15.6
GRSF1Q12849 MBD3-205ENST00000589064 1475 ntTSL 221.91■■□□□ 1.13e-15■■■□□ 15.6
GRSF1Q12849 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.913e-15■■■□□ 15.6
GRSF1Q12849 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.623e-15■■■□□ 15.6
GRSF1Q12849 MBD3-209ENST00000592012 2379 ntTSL 518.77■□□□□ 0.63e-15■■■□□ 15.6
GRSF1Q12849 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.553e-15■■■□□ 15.6
GRSF1Q12849 MBD3-210ENST00000592361 907 ntTSL 518.24■□□□□ 0.513e-15■■■□□ 15.6
GRSF1Q12849 MBD3-204ENST00000585967 583 ntTSL 418.24■□□□□ 0.513e-15■■■□□ 15.6
GRSF1Q12849 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.052e-7■■■□□ 15.5
GRSF1Q12849 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.082e-7■■■□□ 15.5
GRSF1Q12849 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.292e-7■■■□□ 15.5
GRSF1Q12849 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.263e-6■■■□□ 15.5
GRSF1Q12849 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.933e-6■■■□□ 15.5
GRSF1Q12849 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.863e-6■■■□□ 15.5
GRSF1Q12849 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.793e-6■■■□□ 15.5
GRSF1Q12849 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.733e-6■■■□□ 15.5
GRSF1Q12849 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.473e-6■■■□□ 15.5
GRSF1Q12849 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.323e-6■■■□□ 15.5
GRSF1Q12849 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.562e-6■■■□□ 15.5
GRSF1Q12849 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.42e-6■■■□□ 15.5
GRSF1Q12849 EIF3B-210ENST00000468611 1868 ntTSL 215.35■□□□□ 0.052e-6■■■□□ 15.5
GRSF1Q12849 EIF3B-207ENST00000465670 2766 ntTSL 214.56□□□□□ -0.082e-6■■■□□ 15.5
GRSF1Q12849 EIF3B-211ENST00000475415 3745 ntTSL 210.14□□□□□ -0.792e-6■■■□□ 15.5
GRSF1Q12849 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.151e-8■■■□□ 15.4
GRSF1Q12849 FAM129B-206ENST00000478917 362 ntTSL 514.67□□□□□ -0.061e-8■■■□□ 15.4
GRSF1Q12849 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.161e-8■■■□□ 15.4
GRSF1Q12849 TAF4-203ENST00000474089 532 ntTSL 220.75■□□□□ 0.916e-8■■■□□ 15.4
GRSF1Q12849 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.726e-8■■■□□ 15.4
GRSF1Q12849 PSMD13-211ENST00000532025 653 ntTSL 317.89■□□□□ 0.456e-8■■■□□ 15.4
GRSF1Q12849 PSMD13-202ENST00000382671 1489 ntTSL 1 (best)16.53■□□□□ 0.246e-8■■■□□ 15.4
GRSF1Q12849 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.116e-8■■■□□ 15.4
GRSF1Q12849 PSMD13-204ENST00000525665 1632 ntTSL 515.57■□□□□ 0.086e-8■■■□□ 15.4
GRSF1Q12849 TAF4-202ENST00000436129 2440 ntTSL 215.32■□□□□ 0.046e-8■■■□□ 15.4
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GRSF1Q12849 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.016e-8■■■□□ 15.4
GRSF1Q12849 KDM2A-207ENST00000526258 5671 ntTSL 1 (best)13.18□□□□□ -0.36e-8■■■□□ 15.4
GRSF1Q12849 PSMD13-201ENST00000352303 1427 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.336e-8■■■□□ 15.4
GRSF1Q12849 KDM2A-210ENST00000529006 6967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.476e-8■■■□□ 15.4
GRSF1Q12849 PSMD13-207ENST00000527982 2200 nt11.54□□□□□ -0.566e-8■■■□□ 15.4
GRSF1Q12849 PSMD13-205ENST00000526783 892 ntTSL 511.39□□□□□ -0.596e-8■■■□□ 15.4
GRSF1Q12849 SKI-204ENST00000508416 252 ntTSL 310.96□□□□□ -0.656e-8■■■□□ 15.4
GRSF1Q12849 KDM2A-204ENST00000524657 3692 ntTSL 1 (best)9.79□□□□□ -0.846e-8■■■□□ 15.4
GRSF1Q12849 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.43e-6■■■□□ 15.3
GRSF1Q12849 PHF10-206ENST00000621772 1651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.242e-11■■■□□ 15.3
GRSF1Q12849 TNRC6C-207ENST00000588847 8527 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.419e-7■■■□□ 15.2
GRSF1Q12849 TNRC6C-205ENST00000588061 8419 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.429e-7■■■□□ 15.2
GRSF1Q12849 TNRC6C-201ENST00000301624 9632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.539e-7■■■□□ 15.2
GRSF1Q12849 TNRC6C-202ENST00000335749 9740 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.579e-7■■■□□ 15.2
GRSF1Q12849 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.297e-8■■■□□ 15.2
GRSF1Q12849 METTL21A-212ENST00000471128 546 ntTSL 421.98■■□□□ 1.117e-8■■■□□ 15.2
GRSF1Q12849 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.947e-8■■■□□ 15.2
GRSF1Q12849 METTL21A-211ENST00000461419 559 ntTSL 520.78■□□□□ 0.927e-8■■■□□ 15.2
GRSF1Q12849 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.897e-8■■■□□ 15.2
GRSF1Q12849 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.887e-8■■■□□ 15.2
GRSF1Q12849 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.837e-8■■■□□ 15.2
GRSF1Q12849 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.577e-8■■■□□ 15.2
GRSF1Q12849 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.547e-8■■■□□ 15.2
GRSF1Q12849 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.427e-8■■■□□ 15.2
GRSF1Q12849 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.387e-8■■■□□ 15.2
GRSF1Q12849 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.27e-8■■■□□ 15.2
GRSF1Q12849 TKT-204ENST00000450814 1941 ntTSL 217.23■□□□□ 0.352e-8■■■□□ 15.2
GRSF1Q12849 TKT-211ENST00000472528 1055 ntTSL 1 (best)15.71■□□□□ 0.112e-8■■■□□ 15.2
GRSF1Q12849 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.082e-8■■■□□ 15.2
GRSF1Q12849 TKT-210ENST00000469678 1871 ntTSL 514.63□□□□□ -0.072e-8■■■□□ 15.2
GRSF1Q12849 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.082e-8■■■□□ 15.2
GRSF1Q12849 TKT-214ENST00000494523 1955 ntTSL 213.01□□□□□ -0.332e-8■■■□□ 15.2
GRSF1Q12849 TKT-203ENST00000423525 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.382e-8■■■□□ 15.2
GRSF1Q12849 TKT-206ENST00000460343 7286 ntTSL 211.5□□□□□ -0.572e-8■■■□□ 15.2
GRSF1Q12849 TKT-208ENST00000462138 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.612e-8■■■□□ 15.2
GRSF1Q12849 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.184e-8■■■□□ 15.1
GRSF1Q12849 ADIPOR2-201ENST00000357103 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.645e-8■■■□□ 15.1
GRSF1Q12849 NOMO2-204ENST00000562312 682 ntTSL 525.25■■□□□ 1.632e-24■■■□□ 15
GRSF1Q12849 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.42e-24■■■□□ 15
GRSF1Q12849 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.332e-24■■■□□ 15
GRSF1Q12849 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.292e-24■■■□□ 15
GRSF1Q12849 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.222e-24■■■□□ 15
GRSF1Q12849 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.032e-24■■■□□ 15
GRSF1Q12849 NOMO2-206ENST00000564991 3765 ntTSL 515.26■□□□□ 0.032e-24■■■□□ 15
GRSF1Q12849 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.611e-7■■■□□ 15
GRSF1Q12849 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.51e-7■■■□□ 15
GRSF1Q12849 C12orf49-203ENST00000547630 1371 ntTSL 1 (best)21.31■■□□□ 11e-7■■■□□ 15
GRSF1Q12849 EBP-201ENST00000276096 904 ntTSL 217.54■□□□□ 0.41e-7■■■□□ 15
GRSF1Q12849 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.31e-7■■■□□ 15
GRSF1Q12849 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.071e-7■■■□□ 15
GRSF1Q12849 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.11e-7■■■□□ 15
GRSF1Q12849 ARFGEF2-201ENST00000371917 8852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.467e-11■■■□□ 15
GRSF1Q12849 MGAT5-201ENST00000281923 8144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.963e-7■■■□□ 14.9
GRSF1Q12849 MGAT5-202ENST00000409645 8252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.093e-7■■■□□ 14.9
GRSF1Q12849 PITPNA-210ENST00000576722 793 ntTSL 329.3■■■□□ 2.283e-6■■■□□ 14.9
GRSF1Q12849 PITPNA-207ENST00000575288 1264 ntTSL 228.79■■■□□ 2.23e-6■■■□□ 14.9
GRSF1Q12849 PITPNA-209ENST00000576010 573 ntTSL 527.43■■□□□ 1.983e-6■■■□□ 14.9
GRSF1Q12849 PITPNA-211ENST00000576761 589 ntTSL 427.43■■□□□ 1.983e-6■■■□□ 14.9
GRSF1Q12849 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.293e-6■■■□□ 14.9
GRSF1Q12849 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.13e-6■■■□□ 14.9
GRSF1Q12849 PITPNA-205ENST00000573231 504 ntTSL 410.77□□□□□ -0.693e-6■■■□□ 14.9
GRSF1Q12849 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.086e-11■■■□□ 14.8
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