Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CACNB2Q08289 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CACNB2Q08289 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
CACNB2Q08289 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CACNB2Q08289 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
CACNB2Q08289 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
CACNB2Q08289 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CACNB2Q08289 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CACNB2Q08289 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
CACNB2Q08289 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CACNB2Q08289 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CACNB2Q08289 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CACNB2Q08289 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CACNB2Q08289 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CACNB2Q08289 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CACNB2Q08289 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CACNB2Q08289 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CACNB2Q08289 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CACNB2Q08289 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CACNB2Q08289 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CACNB2Q08289 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
CACNB2Q08289 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
CACNB2Q08289 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CACNB2Q08289 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CACNB2Q08289 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CACNB2Q08289 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CACNB2Q08289 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CACNB2Q08289 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CACNB2Q08289 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CACNB2Q08289 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CACNB2Q08289 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CACNB2Q08289 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CACNB2Q08289 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CACNB2Q08289 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CACNB2Q08289 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CACNB2Q08289 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CACNB2Q08289 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CACNB2Q08289 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CACNB2Q08289 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CACNB2Q08289 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CACNB2Q08289 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CACNB2Q08289 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CACNB2Q08289 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CACNB2Q08289 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CACNB2Q08289 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CACNB2Q08289 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CACNB2Q08289 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CACNB2Q08289 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CACNB2Q08289 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CACNB2Q08289 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CACNB2Q08289 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CACNB2Q08289 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CACNB2Q08289 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CACNB2Q08289 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CACNB2Q08289 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CACNB2Q08289 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CACNB2Q08289 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CACNB2Q08289 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CACNB2Q08289 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CACNB2Q08289 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CACNB2Q08289 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CACNB2Q08289 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CACNB2Q08289 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CACNB2Q08289 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CACNB2Q08289 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CACNB2Q08289 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CACNB2Q08289 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CACNB2Q08289 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CACNB2Q08289 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CACNB2Q08289 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CACNB2Q08289 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CACNB2Q08289 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CACNB2Q08289 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CACNB2Q08289 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CACNB2Q08289 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CACNB2Q08289 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CACNB2Q08289 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CACNB2Q08289 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CACNB2Q08289 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CACNB2Q08289 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CACNB2Q08289 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CACNB2Q08289 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CACNB2Q08289 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CACNB2Q08289 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CACNB2Q08289 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CACNB2Q08289 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CACNB2Q08289 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CACNB2Q08289 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CACNB2Q08289 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CACNB2Q08289 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CACNB2Q08289 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CACNB2Q08289 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CACNB2Q08289 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CACNB2Q08289 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CACNB2Q08289 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CACNB2Q08289 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CACNB2Q08289 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CACNB2Q08289 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CACNB2Q08289 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CACNB2Q08289 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms