Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
HERVK_113P62684 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
HERVK_113P62684 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
HERVK_113P62684 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
HERVK_113P62684 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
HERVK_113P62684 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
HERVK_113P62684 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
HERVK_113P62684 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
HERVK_113P62684 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
HERVK_113P62684 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
HERVK_113P62684 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
HERVK_113P62684 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
HERVK_113P62684 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
HERVK_113P62684 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
HERVK_113P62684 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
HERVK_113P62684 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
HERVK_113P62684 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
HERVK_113P62684 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
HERVK_113P62684 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
HERVK_113P62684 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
HERVK_113P62684 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
HERVK_113P62684 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
HERVK_113P62684 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
HERVK_113P62684 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
HERVK_113P62684 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
HERVK_113P62684 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
HERVK_113P62684 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
HERVK_113P62684 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HERVK_113P62684 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
HERVK_113P62684 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
HERVK_113P62684 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
HERVK_113P62684 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
HERVK_113P62684 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HERVK_113P62684 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
HERVK_113P62684 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HERVK_113P62684 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
HERVK_113P62684 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
HERVK_113P62684 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
HERVK_113P62684 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HERVK_113P62684 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
HERVK_113P62684 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
HERVK_113P62684 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
HERVK_113P62684 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
HERVK_113P62684 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
HERVK_113P62684 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
HERVK_113P62684 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
HERVK_113P62684 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HERVK_113P62684 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HERVK_113P62684 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
HERVK_113P62684 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
HERVK_113P62684 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
HERVK_113P62684 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
HERVK_113P62684 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
HERVK_113P62684 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
HERVK_113P62684 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
HERVK_113P62684 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
HERVK_113P62684 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
HERVK_113P62684 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HERVK_113P62684 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
HERVK_113P62684 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
HERVK_113P62684 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
HERVK_113P62684 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
HERVK_113P62684 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
HERVK_113P62684 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HERVK_113P62684 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HERVK_113P62684 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
HERVK_113P62684 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
HERVK_113P62684 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HERVK_113P62684 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HERVK_113P62684 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HERVK_113P62684 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
HERVK_113P62684 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
HERVK_113P62684 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
HERVK_113P62684 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
HERVK_113P62684 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
HERVK_113P62684 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
HERVK_113P62684 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HERVK_113P62684 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HERVK_113P62684 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
HERVK_113P62684 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HERVK_113P62684 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
HERVK_113P62684 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
HERVK_113P62684 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
HERVK_113P62684 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HERVK_113P62684 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HERVK_113P62684 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
HERVK_113P62684 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
HERVK_113P62684 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
HERVK_113P62684 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HERVK_113P62684 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
HERVK_113P62684 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HERVK_113P62684 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HERVK_113P62684 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
HERVK_113P62684 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
HERVK_113P62684 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
HERVK_113P62684 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
HERVK_113P62684 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HERVK_113P62684 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HERVK_113P62684 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
HERVK_113P62684 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.9 ms