Protein–RNA interactions for Protein: P57103

SLC8A3, Sodium/calcium exchanger 3, humanhuman

Predictions only

Length 927 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC8A3P57103 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC8A3P57103 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC8A3P57103 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC8A3P57103 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC8A3P57103 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC8A3P57103 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC8A3P57103 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC8A3P57103 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC8A3P57103 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC8A3P57103 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC8A3P57103 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC8A3P57103 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC8A3P57103 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC8A3P57103 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC8A3P57103 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC8A3P57103 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC8A3P57103 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SLC8A3P57103 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SLC8A3P57103 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
SLC8A3P57103 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC8A3P57103 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC8A3P57103 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC8A3P57103 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC8A3P57103 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC8A3P57103 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC8A3P57103 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC8A3P57103 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC8A3P57103 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC8A3P57103 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC8A3P57103 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC8A3P57103 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC8A3P57103 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC8A3P57103 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC8A3P57103 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC8A3P57103 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC8A3P57103 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC8A3P57103 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC8A3P57103 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC8A3P57103 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC8A3P57103 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC8A3P57103 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC8A3P57103 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC8A3P57103 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC8A3P57103 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC8A3P57103 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC8A3P57103 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC8A3P57103 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC8A3P57103 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC8A3P57103 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC8A3P57103 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC8A3P57103 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC8A3P57103 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC8A3P57103 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SLC8A3P57103 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SLC8A3P57103 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SLC8A3P57103 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC8A3P57103 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC8A3P57103 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC8A3P57103 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC8A3P57103 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC8A3P57103 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC8A3P57103 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC8A3P57103 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC8A3P57103 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC8A3P57103 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC8A3P57103 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC8A3P57103 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC8A3P57103 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC8A3P57103 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC8A3P57103 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC8A3P57103 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC8A3P57103 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC8A3P57103 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC8A3P57103 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC8A3P57103 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC8A3P57103 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC8A3P57103 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC8A3P57103 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC8A3P57103 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC8A3P57103 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC8A3P57103 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC8A3P57103 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC8A3P57103 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC8A3P57103 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC8A3P57103 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC8A3P57103 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC8A3P57103 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC8A3P57103 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SLC8A3P57103 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC8A3P57103 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC8A3P57103 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC8A3P57103 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC8A3P57103 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC8A3P57103 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC8A3P57103 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC8A3P57103 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC8A3P57103 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC8A3P57103 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC8A3P57103 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC8A3P57103 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms