Protein–RNA interactions for Protein: P56199

ITGA1, Integrin alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA1P56199 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITGA1P56199 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITGA1P56199 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITGA1P56199 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITGA1P56199 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGA1P56199 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGA1P56199 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGA1P56199 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGA1P56199 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGA1P56199 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGA1P56199 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGA1P56199 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGA1P56199 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGA1P56199 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGA1P56199 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGA1P56199 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGA1P56199 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGA1P56199 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGA1P56199 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGA1P56199 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGA1P56199 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGA1P56199 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGA1P56199 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGA1P56199 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGA1P56199 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGA1P56199 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGA1P56199 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ITGA1P56199 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ITGA1P56199 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ITGA1P56199 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ITGA1P56199 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ITGA1P56199 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ITGA1P56199 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ITGA1P56199 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ITGA1P56199 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ITGA1P56199 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ITGA1P56199 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ITGA1P56199 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ITGA1P56199 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ITGA1P56199 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ITGA1P56199 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ITGA1P56199 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ITGA1P56199 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ITGA1P56199 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ITGA1P56199 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ITGA1P56199 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ITGA1P56199 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGA1P56199 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGA1P56199 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGA1P56199 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGA1P56199 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGA1P56199 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGA1P56199 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGA1P56199 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGA1P56199 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGA1P56199 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGA1P56199 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGA1P56199 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGA1P56199 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGA1P56199 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITGA1P56199 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITGA1P56199 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITGA1P56199 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGA1P56199 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGA1P56199 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGA1P56199 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGA1P56199 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ITGA1P56199 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITGA1P56199 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITGA1P56199 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITGA1P56199 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITGA1P56199 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITGA1P56199 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITGA1P56199 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITGA1P56199 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITGA1P56199 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITGA1P56199 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITGA1P56199 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITGA1P56199 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ITGA1P56199 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITGA1P56199 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITGA1P56199 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITGA1P56199 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGA1P56199 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGA1P56199 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGA1P56199 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGA1P56199 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGA1P56199 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGA1P56199 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGA1P56199 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGA1P56199 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGA1P56199 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGA1P56199 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGA1P56199 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGA1P56199 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGA1P56199 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGA1P56199 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGA1P56199 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGA1P56199 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGA1P56199 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms