Protein–RNA interactions for Protein: P56159

GFRA1, GDNF family receptor alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA1P56159 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GFRA1P56159 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GFRA1P56159 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GFRA1P56159 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GFRA1P56159 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GFRA1P56159 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GFRA1P56159 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GFRA1P56159 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GFRA1P56159 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GFRA1P56159 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GFRA1P56159 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GFRA1P56159 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
GFRA1P56159 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GFRA1P56159 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GFRA1P56159 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GFRA1P56159 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GFRA1P56159 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GFRA1P56159 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GFRA1P56159 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GFRA1P56159 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GFRA1P56159 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GFRA1P56159 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GFRA1P56159 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GFRA1P56159 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
GFRA1P56159 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GFRA1P56159 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GFRA1P56159 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GFRA1P56159 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GFRA1P56159 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GFRA1P56159 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GFRA1P56159 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GFRA1P56159 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GFRA1P56159 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GFRA1P56159 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GFRA1P56159 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GFRA1P56159 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GFRA1P56159 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GFRA1P56159 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GFRA1P56159 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GFRA1P56159 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GFRA1P56159 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GFRA1P56159 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GFRA1P56159 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GFRA1P56159 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GFRA1P56159 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GFRA1P56159 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GFRA1P56159 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GFRA1P56159 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GFRA1P56159 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GFRA1P56159 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GFRA1P56159 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
GFRA1P56159 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GFRA1P56159 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GFRA1P56159 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GFRA1P56159 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GFRA1P56159 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GFRA1P56159 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GFRA1P56159 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GFRA1P56159 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GFRA1P56159 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GFRA1P56159 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GFRA1P56159 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GFRA1P56159 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GFRA1P56159 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GFRA1P56159 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GFRA1P56159 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GFRA1P56159 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GFRA1P56159 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GFRA1P56159 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GFRA1P56159 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GFRA1P56159 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GFRA1P56159 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GFRA1P56159 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GFRA1P56159 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GFRA1P56159 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GFRA1P56159 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GFRA1P56159 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GFRA1P56159 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GFRA1P56159 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GFRA1P56159 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
GFRA1P56159 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GFRA1P56159 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GFRA1P56159 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GFRA1P56159 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GFRA1P56159 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GFRA1P56159 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GFRA1P56159 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
GFRA1P56159 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
GFRA1P56159 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GFRA1P56159 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
GFRA1P56159 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
GFRA1P56159 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GFRA1P56159 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GFRA1P56159 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GFRA1P56159 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GFRA1P56159 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GFRA1P56159 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
GFRA1P56159 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GFRA1P56159 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GFRA1P56159 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms