Protein–RNA interactions for Protein: P54252

ATXN3, Ataxin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN3P54252 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ATXN3P54252 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATXN3P54252 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATXN3P54252 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ATXN3P54252 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATXN3P54252 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATXN3P54252 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATXN3P54252 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATXN3P54252 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATXN3P54252 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATXN3P54252 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATXN3P54252 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATXN3P54252 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATXN3P54252 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATXN3P54252 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATXN3P54252 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATXN3P54252 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATXN3P54252 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATXN3P54252 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ATXN3P54252 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATXN3P54252 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATXN3P54252 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATXN3P54252 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATXN3P54252 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATXN3P54252 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATXN3P54252 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATXN3P54252 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATXN3P54252 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATXN3P54252 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATXN3P54252 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATXN3P54252 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATXN3P54252 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATXN3P54252 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATXN3P54252 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ATXN3P54252 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATXN3P54252 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATXN3P54252 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATXN3P54252 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATXN3P54252 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATXN3P54252 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATXN3P54252 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATXN3P54252 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATXN3P54252 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATXN3P54252 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATXN3P54252 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATXN3P54252 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATXN3P54252 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATXN3P54252 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATXN3P54252 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATXN3P54252 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATXN3P54252 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATXN3P54252 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
ATXN3P54252 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATXN3P54252 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATXN3P54252 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATXN3P54252 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATXN3P54252 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ATXN3P54252 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATXN3P54252 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATXN3P54252 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATXN3P54252 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATXN3P54252 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ATXN3P54252 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATXN3P54252 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATXN3P54252 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATXN3P54252 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ATXN3P54252 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATXN3P54252 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATXN3P54252 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ATXN3P54252 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATXN3P54252 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATXN3P54252 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATXN3P54252 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATXN3P54252 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATXN3P54252 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATXN3P54252 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATXN3P54252 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATXN3P54252 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATXN3P54252 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATXN3P54252 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATXN3P54252 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ATXN3P54252 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ATXN3P54252 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATXN3P54252 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATXN3P54252 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATXN3P54252 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATXN3P54252 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
ATXN3P54252 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATXN3P54252 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATXN3P54252 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATXN3P54252 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATXN3P54252 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATXN3P54252 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATXN3P54252 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ATXN3P54252 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ATXN3P54252 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATXN3P54252 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATXN3P54252 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATXN3P54252 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATXN3P54252 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms