Protein–RNA interactions for Protein: P53611

RABGGTB, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTBP53611 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RABGGTBP53611 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RABGGTBP53611 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RABGGTBP53611 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RABGGTBP53611 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
RABGGTBP53611 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RABGGTBP53611 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
RABGGTBP53611 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RABGGTBP53611 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RABGGTBP53611 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RABGGTBP53611 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RABGGTBP53611 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RABGGTBP53611 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RABGGTBP53611 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RABGGTBP53611 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RABGGTBP53611 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RABGGTBP53611 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RABGGTBP53611 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RABGGTBP53611 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RABGGTBP53611 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RABGGTBP53611 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RABGGTBP53611 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RABGGTBP53611 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RABGGTBP53611 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RABGGTBP53611 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
RABGGTBP53611 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RABGGTBP53611 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RABGGTBP53611 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RABGGTBP53611 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RABGGTBP53611 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RABGGTBP53611 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
RABGGTBP53611 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RABGGTBP53611 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RABGGTBP53611 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RABGGTBP53611 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RABGGTBP53611 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
RABGGTBP53611 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RABGGTBP53611 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RABGGTBP53611 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RABGGTBP53611 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RABGGTBP53611 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
RABGGTBP53611 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RABGGTBP53611 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RABGGTBP53611 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
RABGGTBP53611 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RABGGTBP53611 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RABGGTBP53611 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RABGGTBP53611 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RABGGTBP53611 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RABGGTBP53611 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RABGGTBP53611 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
RABGGTBP53611 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RABGGTBP53611 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RABGGTBP53611 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RABGGTBP53611 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RABGGTBP53611 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RABGGTBP53611 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RABGGTBP53611 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RABGGTBP53611 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RABGGTBP53611 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RABGGTBP53611 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RABGGTBP53611 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RABGGTBP53611 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
RABGGTBP53611 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RABGGTBP53611 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RABGGTBP53611 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RABGGTBP53611 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RABGGTBP53611 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RABGGTBP53611 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RABGGTBP53611 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RABGGTBP53611 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RABGGTBP53611 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
RABGGTBP53611 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RABGGTBP53611 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RABGGTBP53611 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RABGGTBP53611 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RABGGTBP53611 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RABGGTBP53611 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RABGGTBP53611 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RABGGTBP53611 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RABGGTBP53611 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RABGGTBP53611 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RABGGTBP53611 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RABGGTBP53611 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RABGGTBP53611 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RABGGTBP53611 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RABGGTBP53611 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RABGGTBP53611 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RABGGTBP53611 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RABGGTBP53611 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RABGGTBP53611 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RABGGTBP53611 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RABGGTBP53611 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RABGGTBP53611 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RABGGTBP53611 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RABGGTBP53611 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RABGGTBP53611 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RABGGTBP53611 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RABGGTBP53611 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RABGGTBP53611 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms