Protein–RNA interactions for Protein: P53611

RABGGTB, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTBP53611 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RABGGTBP53611 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RABGGTBP53611 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RABGGTBP53611 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RABGGTBP53611 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
RABGGTBP53611 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RABGGTBP53611 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
RABGGTBP53611 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RABGGTBP53611 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RABGGTBP53611 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RABGGTBP53611 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RABGGTBP53611 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RABGGTBP53611 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RABGGTBP53611 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RABGGTBP53611 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RABGGTBP53611 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RABGGTBP53611 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RABGGTBP53611 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RABGGTBP53611 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RABGGTBP53611 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RABGGTBP53611 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RABGGTBP53611 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RABGGTBP53611 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RABGGTBP53611 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RABGGTBP53611 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
RABGGTBP53611 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RABGGTBP53611 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RABGGTBP53611 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RABGGTBP53611 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RABGGTBP53611 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RABGGTBP53611 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
RABGGTBP53611 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RABGGTBP53611 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RABGGTBP53611 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RABGGTBP53611 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RABGGTBP53611 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
RABGGTBP53611 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RABGGTBP53611 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RABGGTBP53611 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RABGGTBP53611 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RABGGTBP53611 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
RABGGTBP53611 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RABGGTBP53611 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RABGGTBP53611 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
RABGGTBP53611 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RABGGTBP53611 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RABGGTBP53611 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RABGGTBP53611 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RABGGTBP53611 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RABGGTBP53611 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RABGGTBP53611 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
RABGGTBP53611 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RABGGTBP53611 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RABGGTBP53611 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RABGGTBP53611 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RABGGTBP53611 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RABGGTBP53611 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RABGGTBP53611 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RABGGTBP53611 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RABGGTBP53611 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RABGGTBP53611 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RABGGTBP53611 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RABGGTBP53611 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
RABGGTBP53611 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RABGGTBP53611 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RABGGTBP53611 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RABGGTBP53611 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RABGGTBP53611 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RABGGTBP53611 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RABGGTBP53611 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RABGGTBP53611 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RABGGTBP53611 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
RABGGTBP53611 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RABGGTBP53611 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RABGGTBP53611 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RABGGTBP53611 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RABGGTBP53611 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RABGGTBP53611 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RABGGTBP53611 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RABGGTBP53611 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RABGGTBP53611 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RABGGTBP53611 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RABGGTBP53611 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RABGGTBP53611 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RABGGTBP53611 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RABGGTBP53611 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RABGGTBP53611 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RABGGTBP53611 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RABGGTBP53611 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RABGGTBP53611 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RABGGTBP53611 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RABGGTBP53611 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RABGGTBP53611 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RABGGTBP53611 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RABGGTBP53611 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RABGGTBP53611 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RABGGTBP53611 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RABGGTBP53611 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RABGGTBP53611 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RABGGTBP53611 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
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