Protein–RNA interactions for Protein: P51965

UBE2E1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E1P51965 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
UBE2E1P51965 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
UBE2E1P51965 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
UBE2E1P51965 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
UBE2E1P51965 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
UBE2E1P51965 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
UBE2E1P51965 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
UBE2E1P51965 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
UBE2E1P51965 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
UBE2E1P51965 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
UBE2E1P51965 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
UBE2E1P51965 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
UBE2E1P51965 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
UBE2E1P51965 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
UBE2E1P51965 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
UBE2E1P51965 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
UBE2E1P51965 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
UBE2E1P51965 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
UBE2E1P51965 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
UBE2E1P51965 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
UBE2E1P51965 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
UBE2E1P51965 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
UBE2E1P51965 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
UBE2E1P51965 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
UBE2E1P51965 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
UBE2E1P51965 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
UBE2E1P51965 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
UBE2E1P51965 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
UBE2E1P51965 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
UBE2E1P51965 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
UBE2E1P51965 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
UBE2E1P51965 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
UBE2E1P51965 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
UBE2E1P51965 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
UBE2E1P51965 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
UBE2E1P51965 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.74
UBE2E1P51965 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
UBE2E1P51965 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
UBE2E1P51965 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
UBE2E1P51965 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
UBE2E1P51965 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
UBE2E1P51965 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
UBE2E1P51965 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
UBE2E1P51965 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
UBE2E1P51965 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
UBE2E1P51965 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
UBE2E1P51965 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
UBE2E1P51965 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
UBE2E1P51965 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
UBE2E1P51965 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
UBE2E1P51965 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
UBE2E1P51965 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
UBE2E1P51965 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
UBE2E1P51965 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
UBE2E1P51965 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
UBE2E1P51965 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
UBE2E1P51965 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
UBE2E1P51965 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
UBE2E1P51965 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
UBE2E1P51965 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
UBE2E1P51965 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
UBE2E1P51965 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
UBE2E1P51965 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
UBE2E1P51965 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
UBE2E1P51965 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
UBE2E1P51965 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
UBE2E1P51965 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
UBE2E1P51965 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
UBE2E1P51965 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
UBE2E1P51965 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
UBE2E1P51965 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
UBE2E1P51965 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
UBE2E1P51965 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
UBE2E1P51965 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
UBE2E1P51965 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
UBE2E1P51965 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
UBE2E1P51965 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
UBE2E1P51965 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
UBE2E1P51965 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
UBE2E1P51965 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
UBE2E1P51965 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
UBE2E1P51965 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
UBE2E1P51965 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
UBE2E1P51965 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
UBE2E1P51965 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
UBE2E1P51965 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
UBE2E1P51965 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
UBE2E1P51965 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
UBE2E1P51965 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
UBE2E1P51965 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
UBE2E1P51965 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
UBE2E1P51965 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
UBE2E1P51965 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
UBE2E1P51965 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
UBE2E1P51965 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
UBE2E1P51965 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
UBE2E1P51965 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
UBE2E1P51965 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
UBE2E1P51965 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
UBE2E1P51965 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms