Protein–RNA interactions for Protein: P51797

CLCN6, Chloride transport protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN6P51797 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CLCN6P51797 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CLCN6P51797 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CLCN6P51797 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLCN6P51797 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLCN6P51797 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CLCN6P51797 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLCN6P51797 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLCN6P51797 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLCN6P51797 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLCN6P51797 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLCN6P51797 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLCN6P51797 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLCN6P51797 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLCN6P51797 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLCN6P51797 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CLCN6P51797 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLCN6P51797 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLCN6P51797 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CLCN6P51797 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLCN6P51797 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLCN6P51797 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLCN6P51797 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLCN6P51797 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLCN6P51797 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLCN6P51797 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLCN6P51797 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLCN6P51797 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLCN6P51797 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLCN6P51797 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CLCN6P51797 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CLCN6P51797 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CLCN6P51797 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CLCN6P51797 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLCN6P51797 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLCN6P51797 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLCN6P51797 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CLCN6P51797 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLCN6P51797 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLCN6P51797 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLCN6P51797 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLCN6P51797 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLCN6P51797 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLCN6P51797 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLCN6P51797 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLCN6P51797 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLCN6P51797 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLCN6P51797 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLCN6P51797 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLCN6P51797 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLCN6P51797 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLCN6P51797 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLCN6P51797 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLCN6P51797 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CLCN6P51797 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLCN6P51797 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLCN6P51797 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLCN6P51797 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CLCN6P51797 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLCN6P51797 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLCN6P51797 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLCN6P51797 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CLCN6P51797 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CLCN6P51797 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLCN6P51797 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLCN6P51797 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLCN6P51797 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLCN6P51797 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLCN6P51797 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLCN6P51797 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLCN6P51797 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLCN6P51797 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLCN6P51797 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLCN6P51797 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLCN6P51797 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLCN6P51797 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLCN6P51797 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLCN6P51797 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLCN6P51797 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLCN6P51797 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLCN6P51797 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLCN6P51797 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLCN6P51797 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLCN6P51797 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLCN6P51797 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CLCN6P51797 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CLCN6P51797 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CLCN6P51797 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CLCN6P51797 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CLCN6P51797 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CLCN6P51797 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CLCN6P51797 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLCN6P51797 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLCN6P51797 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLCN6P51797 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLCN6P51797 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLCN6P51797 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLCN6P51797 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLCN6P51797 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLCN6P51797 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms