Protein–RNA interactions for Protein: P51681

CCR5, C-C chemokine receptor type 5, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR5P51681 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCR5P51681 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCR5P51681 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCR5P51681 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCR5P51681 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCR5P51681 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCR5P51681 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCR5P51681 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCR5P51681 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCR5P51681 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCR5P51681 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCR5P51681 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CCR5P51681 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCR5P51681 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCR5P51681 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCR5P51681 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCR5P51681 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCR5P51681 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CCR5P51681 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCR5P51681 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCR5P51681 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCR5P51681 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCR5P51681 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCR5P51681 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCR5P51681 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCR5P51681 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCR5P51681 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCR5P51681 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCR5P51681 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCR5P51681 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCR5P51681 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCR5P51681 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCR5P51681 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCR5P51681 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCR5P51681 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCR5P51681 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCR5P51681 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCR5P51681 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCR5P51681 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCR5P51681 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCR5P51681 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCR5P51681 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCR5P51681 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCR5P51681 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCR5P51681 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCR5P51681 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCR5P51681 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCR5P51681 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCR5P51681 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CCR5P51681 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCR5P51681 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCR5P51681 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCR5P51681 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCR5P51681 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCR5P51681 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCR5P51681 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCR5P51681 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCR5P51681 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCR5P51681 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCR5P51681 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CCR5P51681 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCR5P51681 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCR5P51681 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCR5P51681 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CCR5P51681 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCR5P51681 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCR5P51681 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCR5P51681 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCR5P51681 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCR5P51681 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCR5P51681 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCR5P51681 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCR5P51681 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CCR5P51681 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCR5P51681 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CCR5P51681 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCR5P51681 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCR5P51681 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCR5P51681 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCR5P51681 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCR5P51681 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCR5P51681 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCR5P51681 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCR5P51681 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCR5P51681 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCR5P51681 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCR5P51681 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCR5P51681 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCR5P51681 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCR5P51681 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCR5P51681 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCR5P51681 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCR5P51681 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCR5P51681 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCR5P51681 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CCR5P51681 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCR5P51681 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CCR5P51681 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCR5P51681 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCR5P51681 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.7 ms