Protein–RNA interactions for Protein: P51170

SCNN1G, Amiloride-sensitive sodium channel subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCNN1GP51170 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SCNN1GP51170 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
SCNN1GP51170 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SCNN1GP51170 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SCNN1GP51170 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SCNN1GP51170 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SCNN1GP51170 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SCNN1GP51170 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SCNN1GP51170 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SCNN1GP51170 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SCNN1GP51170 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SCNN1GP51170 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SCNN1GP51170 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SCNN1GP51170 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SCNN1GP51170 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
SCNN1GP51170 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SCNN1GP51170 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SCNN1GP51170 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
SCNN1GP51170 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SCNN1GP51170 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SCNN1GP51170 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SCNN1GP51170 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SCNN1GP51170 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SCNN1GP51170 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SCNN1GP51170 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
SCNN1GP51170 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SCNN1GP51170 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SCNN1GP51170 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SCNN1GP51170 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SCNN1GP51170 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SCNN1GP51170 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
SCNN1GP51170 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SCNN1GP51170 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SCNN1GP51170 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SCNN1GP51170 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SCNN1GP51170 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SCNN1GP51170 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SCNN1GP51170 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SCNN1GP51170 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SCNN1GP51170 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SCNN1GP51170 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SCNN1GP51170 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SCNN1GP51170 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SCNN1GP51170 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SCNN1GP51170 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SCNN1GP51170 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SCNN1GP51170 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SCNN1GP51170 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SCNN1GP51170 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SCNN1GP51170 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SCNN1GP51170 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SCNN1GP51170 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SCNN1GP51170 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SCNN1GP51170 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SCNN1GP51170 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SCNN1GP51170 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SCNN1GP51170 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SCNN1GP51170 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SCNN1GP51170 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SCNN1GP51170 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SCNN1GP51170 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SCNN1GP51170 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SCNN1GP51170 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SCNN1GP51170 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SCNN1GP51170 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SCNN1GP51170 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SCNN1GP51170 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SCNN1GP51170 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SCNN1GP51170 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SCNN1GP51170 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SCNN1GP51170 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SCNN1GP51170 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SCNN1GP51170 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SCNN1GP51170 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SCNN1GP51170 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SCNN1GP51170 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SCNN1GP51170 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SCNN1GP51170 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
SCNN1GP51170 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SCNN1GP51170 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SCNN1GP51170 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SCNN1GP51170 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SCNN1GP51170 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SCNN1GP51170 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SCNN1GP51170 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SCNN1GP51170 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCNN1GP51170 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCNN1GP51170 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCNN1GP51170 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCNN1GP51170 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCNN1GP51170 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCNN1GP51170 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCNN1GP51170 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCNN1GP51170 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCNN1GP51170 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCNN1GP51170 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCNN1GP51170 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCNN1GP51170 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCNN1GP51170 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCNN1GP51170 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms