Protein–RNA interactions for Protein: P50990

CCT8, T-complex protein 1 subunit theta, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT8P50990 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCT8P50990 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCT8P50990 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCT8P50990 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCT8P50990 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCT8P50990 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCT8P50990 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCT8P50990 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CCT8P50990 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCT8P50990 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCT8P50990 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCT8P50990 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCT8P50990 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCT8P50990 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCT8P50990 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CCT8P50990 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCT8P50990 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCT8P50990 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCT8P50990 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCT8P50990 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCT8P50990 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCT8P50990 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCT8P50990 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCT8P50990 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCT8P50990 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCT8P50990 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCT8P50990 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCT8P50990 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCT8P50990 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCT8P50990 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCT8P50990 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCT8P50990 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCT8P50990 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCT8P50990 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCT8P50990 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCT8P50990 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCT8P50990 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCT8P50990 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CCT8P50990 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCT8P50990 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCT8P50990 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCT8P50990 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCT8P50990 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCT8P50990 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCT8P50990 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCT8P50990 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCT8P50990 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCT8P50990 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCT8P50990 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCT8P50990 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCT8P50990 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCT8P50990 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCT8P50990 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCT8P50990 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCT8P50990 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCT8P50990 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCT8P50990 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCT8P50990 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CCT8P50990 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCT8P50990 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CCT8P50990 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCT8P50990 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCT8P50990 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCT8P50990 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCT8P50990 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCT8P50990 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCT8P50990 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCT8P50990 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCT8P50990 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCT8P50990 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCT8P50990 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCT8P50990 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCT8P50990 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCT8P50990 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
CCT8P50990 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCT8P50990 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCT8P50990 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCT8P50990 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCT8P50990 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCT8P50990 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCT8P50990 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCT8P50990 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCT8P50990 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCT8P50990 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCT8P50990 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCT8P50990 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCT8P50990 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCT8P50990 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCT8P50990 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCT8P50990 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCT8P50990 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCT8P50990 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCT8P50990 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCT8P50990 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCT8P50990 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCT8P50990 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CCT8P50990 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCT8P50990 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CCT8P50990 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCT8P50990 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.4 ms