Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TAF6P49848 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TAF6P49848 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TAF6P49848 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TAF6P49848 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TAF6P49848 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TAF6P49848 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TAF6P49848 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TAF6P49848 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TAF6P49848 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TAF6P49848 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TAF6P49848 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TAF6P49848 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TAF6P49848 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TAF6P49848 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TAF6P49848 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TAF6P49848 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TAF6P49848 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TAF6P49848 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TAF6P49848 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TAF6P49848 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TAF6P49848 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TAF6P49848 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TAF6P49848 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TAF6P49848 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TAF6P49848 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TAF6P49848 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TAF6P49848 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TAF6P49848 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TAF6P49848 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TAF6P49848 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TAF6P49848 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TAF6P49848 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TAF6P49848 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TAF6P49848 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TAF6P49848 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TAF6P49848 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
TAF6P49848 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TAF6P49848 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TAF6P49848 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TAF6P49848 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TAF6P49848 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TAF6P49848 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TAF6P49848 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TAF6P49848 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TAF6P49848 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TAF6P49848 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TAF6P49848 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TAF6P49848 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TAF6P49848 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TAF6P49848 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TAF6P49848 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TAF6P49848 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TAF6P49848 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TAF6P49848 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TAF6P49848 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TAF6P49848 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TAF6P49848 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TAF6P49848 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TAF6P49848 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
TAF6P49848 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
TAF6P49848 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TAF6P49848 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TAF6P49848 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TAF6P49848 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TAF6P49848 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TAF6P49848 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TAF6P49848 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TAF6P49848 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TAF6P49848 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TAF6P49848 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TAF6P49848 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TAF6P49848 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TAF6P49848 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TAF6P49848 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TAF6P49848 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TAF6P49848 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TAF6P49848 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TAF6P49848 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TAF6P49848 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TAF6P49848 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TAF6P49848 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TAF6P49848 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TAF6P49848 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TAF6P49848 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TAF6P49848 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TAF6P49848 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
TAF6P49848 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TAF6P49848 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TAF6P49848 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TAF6P49848 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TAF6P49848 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TAF6P49848 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TAF6P49848 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TAF6P49848 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TAF6P49848 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TAF6P49848 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
TAF6P49848 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TAF6P49848 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TAF6P49848 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms