Protein–RNA interactions for Protein: P49356

FNTB, Protein farnesyltransferase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTBP49356 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FNTBP49356 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FNTBP49356 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FNTBP49356 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
FNTBP49356 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FNTBP49356 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FNTBP49356 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FNTBP49356 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FNTBP49356 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FNTBP49356 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FNTBP49356 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FNTBP49356 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FNTBP49356 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FNTBP49356 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FNTBP49356 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FNTBP49356 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FNTBP49356 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FNTBP49356 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FNTBP49356 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FNTBP49356 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FNTBP49356 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
FNTBP49356 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FNTBP49356 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FNTBP49356 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FNTBP49356 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FNTBP49356 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FNTBP49356 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FNTBP49356 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FNTBP49356 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FNTBP49356 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FNTBP49356 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FNTBP49356 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FNTBP49356 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FNTBP49356 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FNTBP49356 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FNTBP49356 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FNTBP49356 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FNTBP49356 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FNTBP49356 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FNTBP49356 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
FNTBP49356 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
FNTBP49356 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FNTBP49356 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FNTBP49356 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FNTBP49356 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FNTBP49356 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FNTBP49356 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FNTBP49356 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FNTBP49356 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FNTBP49356 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
FNTBP49356 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FNTBP49356 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FNTBP49356 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FNTBP49356 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FNTBP49356 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FNTBP49356 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FNTBP49356 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FNTBP49356 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FNTBP49356 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FNTBP49356 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FNTBP49356 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FNTBP49356 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FNTBP49356 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FNTBP49356 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FNTBP49356 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FNTBP49356 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FNTBP49356 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
FNTBP49356 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FNTBP49356 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FNTBP49356 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FNTBP49356 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FNTBP49356 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FNTBP49356 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FNTBP49356 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FNTBP49356 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FNTBP49356 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FNTBP49356 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
FNTBP49356 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FNTBP49356 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FNTBP49356 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FNTBP49356 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FNTBP49356 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FNTBP49356 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FNTBP49356 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FNTBP49356 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FNTBP49356 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FNTBP49356 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FNTBP49356 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FNTBP49356 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FNTBP49356 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FNTBP49356 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FNTBP49356 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FNTBP49356 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FNTBP49356 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FNTBP49356 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
FNTBP49356 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FNTBP49356 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FNTBP49356 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FNTBP49356 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FNTBP49356 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms