Protein–RNA interactions for Protein: P46527

CDKN1B, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN1BP46527 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDKN1BP46527 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CDKN1BP46527 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CDKN1BP46527 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDKN1BP46527 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDKN1BP46527 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDKN1BP46527 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDKN1BP46527 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDKN1BP46527 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDKN1BP46527 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDKN1BP46527 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDKN1BP46527 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDKN1BP46527 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDKN1BP46527 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDKN1BP46527 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDKN1BP46527 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDKN1BP46527 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CDKN1BP46527 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDKN1BP46527 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDKN1BP46527 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDKN1BP46527 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDKN1BP46527 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDKN1BP46527 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDKN1BP46527 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CDKN1BP46527 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDKN1BP46527 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDKN1BP46527 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDKN1BP46527 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDKN1BP46527 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDKN1BP46527 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDKN1BP46527 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDKN1BP46527 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDKN1BP46527 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDKN1BP46527 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDKN1BP46527 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDKN1BP46527 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDKN1BP46527 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDKN1BP46527 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDKN1BP46527 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDKN1BP46527 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDKN1BP46527 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CDKN1BP46527 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDKN1BP46527 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDKN1BP46527 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDKN1BP46527 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDKN1BP46527 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CDKN1BP46527 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDKN1BP46527 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDKN1BP46527 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CDKN1BP46527 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CDKN1BP46527 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDKN1BP46527 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDKN1BP46527 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDKN1BP46527 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDKN1BP46527 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDKN1BP46527 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDKN1BP46527 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDKN1BP46527 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDKN1BP46527 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDKN1BP46527 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDKN1BP46527 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDKN1BP46527 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDKN1BP46527 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDKN1BP46527 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDKN1BP46527 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDKN1BP46527 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDKN1BP46527 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDKN1BP46527 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDKN1BP46527 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDKN1BP46527 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDKN1BP46527 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDKN1BP46527 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CDKN1BP46527 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDKN1BP46527 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDKN1BP46527 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDKN1BP46527 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDKN1BP46527 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDKN1BP46527 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDKN1BP46527 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDKN1BP46527 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDKN1BP46527 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDKN1BP46527 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDKN1BP46527 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDKN1BP46527 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDKN1BP46527 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDKN1BP46527 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDKN1BP46527 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDKN1BP46527 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDKN1BP46527 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDKN1BP46527 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDKN1BP46527 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDKN1BP46527 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDKN1BP46527 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDKN1BP46527 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDKN1BP46527 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CDKN1BP46527 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDKN1BP46527 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDKN1BP46527 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDKN1BP46527 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDKN1BP46527 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms