Protein–RNA interactions for Protein: P43686

PSMC4, 26S proteasome regulatory subunit 6B, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMC4P43686 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PSMC4P43686 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PSMC4P43686 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PSMC4P43686 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
PSMC4P43686 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PSMC4P43686 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PSMC4P43686 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PSMC4P43686 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PSMC4P43686 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PSMC4P43686 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PSMC4P43686 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PSMC4P43686 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PSMC4P43686 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PSMC4P43686 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PSMC4P43686 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PSMC4P43686 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
PSMC4P43686 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28■■■□□ 2.07
PSMC4P43686 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PSMC4P43686 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PSMC4P43686 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PSMC4P43686 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PSMC4P43686 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PSMC4P43686 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PSMC4P43686 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PSMC4P43686 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PSMC4P43686 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PSMC4P43686 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PSMC4P43686 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PSMC4P43686 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PSMC4P43686 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PSMC4P43686 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PSMC4P43686 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PSMC4P43686 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PSMC4P43686 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PSMC4P43686 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PSMC4P43686 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PSMC4P43686 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PSMC4P43686 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PSMC4P43686 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PSMC4P43686 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PSMC4P43686 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
PSMC4P43686 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PSMC4P43686 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
PSMC4P43686 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
PSMC4P43686 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PSMC4P43686 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
PSMC4P43686 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PSMC4P43686 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PSMC4P43686 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PSMC4P43686 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PSMC4P43686 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PSMC4P43686 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PSMC4P43686 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PSMC4P43686 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PSMC4P43686 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
PSMC4P43686 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
PSMC4P43686 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PSMC4P43686 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PSMC4P43686 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PSMC4P43686 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PSMC4P43686 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PSMC4P43686 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PSMC4P43686 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PSMC4P43686 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PSMC4P43686 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PSMC4P43686 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PSMC4P43686 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PSMC4P43686 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
PSMC4P43686 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PSMC4P43686 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PSMC4P43686 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PSMC4P43686 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PSMC4P43686 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PSMC4P43686 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PSMC4P43686 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PSMC4P43686 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PSMC4P43686 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PSMC4P43686 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PSMC4P43686 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PSMC4P43686 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PSMC4P43686 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PSMC4P43686 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PSMC4P43686 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PSMC4P43686 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PSMC4P43686 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
PSMC4P43686 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PSMC4P43686 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PSMC4P43686 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PSMC4P43686 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PSMC4P43686 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PSMC4P43686 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PSMC4P43686 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PSMC4P43686 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PSMC4P43686 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PSMC4P43686 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PSMC4P43686 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PSMC4P43686 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
PSMC4P43686 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PSMC4P43686 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PSMC4P43686 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms