Protein–RNA interactions for Protein: P43026

GDF5, Growth/differentiation factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF5P43026 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GDF5P43026 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GDF5P43026 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GDF5P43026 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GDF5P43026 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GDF5P43026 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GDF5P43026 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GDF5P43026 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GDF5P43026 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GDF5P43026 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GDF5P43026 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GDF5P43026 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
GDF5P43026 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GDF5P43026 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GDF5P43026 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
GDF5P43026 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GDF5P43026 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GDF5P43026 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GDF5P43026 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GDF5P43026 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GDF5P43026 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GDF5P43026 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GDF5P43026 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GDF5P43026 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GDF5P43026 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GDF5P43026 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GDF5P43026 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GDF5P43026 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GDF5P43026 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GDF5P43026 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GDF5P43026 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GDF5P43026 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GDF5P43026 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GDF5P43026 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GDF5P43026 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GDF5P43026 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GDF5P43026 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GDF5P43026 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GDF5P43026 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GDF5P43026 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
GDF5P43026 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GDF5P43026 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GDF5P43026 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GDF5P43026 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GDF5P43026 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GDF5P43026 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GDF5P43026 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GDF5P43026 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GDF5P43026 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
GDF5P43026 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GDF5P43026 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
GDF5P43026 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
GDF5P43026 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GDF5P43026 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GDF5P43026 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GDF5P43026 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GDF5P43026 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GDF5P43026 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GDF5P43026 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GDF5P43026 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GDF5P43026 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GDF5P43026 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GDF5P43026 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GDF5P43026 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GDF5P43026 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GDF5P43026 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GDF5P43026 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
GDF5P43026 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GDF5P43026 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
GDF5P43026 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GDF5P43026 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GDF5P43026 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GDF5P43026 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GDF5P43026 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GDF5P43026 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GDF5P43026 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GDF5P43026 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GDF5P43026 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GDF5P43026 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GDF5P43026 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GDF5P43026 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GDF5P43026 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GDF5P43026 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GDF5P43026 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GDF5P43026 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GDF5P43026 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GDF5P43026 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GDF5P43026 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GDF5P43026 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GDF5P43026 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GDF5P43026 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
GDF5P43026 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GDF5P43026 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GDF5P43026 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
GDF5P43026 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GDF5P43026 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GDF5P43026 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GDF5P43026 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GDF5P43026 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GDF5P43026 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms