Protein–RNA interactions for Protein: P35680

HNF1B, Hepatocyte nuclear factor 1-beta, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNF1BP35680 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HNF1BP35680 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HNF1BP35680 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HNF1BP35680 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HNF1BP35680 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HNF1BP35680 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HNF1BP35680 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HNF1BP35680 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HNF1BP35680 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HNF1BP35680 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HNF1BP35680 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HNF1BP35680 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HNF1BP35680 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HNF1BP35680 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HNF1BP35680 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HNF1BP35680 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HNF1BP35680 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HNF1BP35680 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HNF1BP35680 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HNF1BP35680 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HNF1BP35680 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HNF1BP35680 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
HNF1BP35680 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HNF1BP35680 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HNF1BP35680 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HNF1BP35680 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HNF1BP35680 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HNF1BP35680 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HNF1BP35680 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HNF1BP35680 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HNF1BP35680 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HNF1BP35680 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HNF1BP35680 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HNF1BP35680 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HNF1BP35680 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HNF1BP35680 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HNF1BP35680 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
HNF1BP35680 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HNF1BP35680 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HNF1BP35680 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HNF1BP35680 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HNF1BP35680 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
HNF1BP35680 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HNF1BP35680 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HNF1BP35680 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HNF1BP35680 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HNF1BP35680 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HNF1BP35680 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HNF1BP35680 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HNF1BP35680 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HNF1BP35680 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HNF1BP35680 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
HNF1BP35680 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HNF1BP35680 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HNF1BP35680 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HNF1BP35680 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HNF1BP35680 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
HNF1BP35680 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HNF1BP35680 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HNF1BP35680 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HNF1BP35680 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HNF1BP35680 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HNF1BP35680 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HNF1BP35680 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HNF1BP35680 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HNF1BP35680 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HNF1BP35680 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HNF1BP35680 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HNF1BP35680 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HNF1BP35680 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HNF1BP35680 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HNF1BP35680 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HNF1BP35680 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HNF1BP35680 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HNF1BP35680 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HNF1BP35680 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HNF1BP35680 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HNF1BP35680 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HNF1BP35680 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HNF1BP35680 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HNF1BP35680 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HNF1BP35680 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HNF1BP35680 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HNF1BP35680 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HNF1BP35680 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HNF1BP35680 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HNF1BP35680 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HNF1BP35680 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HNF1BP35680 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HNF1BP35680 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HNF1BP35680 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HNF1BP35680 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HNF1BP35680 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HNF1BP35680 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HNF1BP35680 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HNF1BP35680 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HNF1BP35680 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HNF1BP35680 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HNF1BP35680 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HNF1BP35680 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms