Protein–RNA interactions for Protein: P35240

NF2, Merlin, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NF2P35240 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NF2P35240 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
NF2P35240 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NF2P35240 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NF2P35240 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NF2P35240 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NF2P35240 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NF2P35240 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NF2P35240 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NF2P35240 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NF2P35240 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NF2P35240 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NF2P35240 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NF2P35240 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
NF2P35240 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NF2P35240 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
NF2P35240 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NF2P35240 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NF2P35240 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NF2P35240 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NF2P35240 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NF2P35240 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NF2P35240 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NF2P35240 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NF2P35240 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NF2P35240 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NF2P35240 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NF2P35240 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NF2P35240 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NF2P35240 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NF2P35240 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NF2P35240 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NF2P35240 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NF2P35240 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NF2P35240 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NF2P35240 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NF2P35240 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NF2P35240 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NF2P35240 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NF2P35240 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
NF2P35240 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NF2P35240 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NF2P35240 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NF2P35240 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NF2P35240 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NF2P35240 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NF2P35240 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NF2P35240 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
NF2P35240 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NF2P35240 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NF2P35240 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NF2P35240 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
NF2P35240 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
NF2P35240 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NF2P35240 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NF2P35240 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NF2P35240 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NF2P35240 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NF2P35240 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NF2P35240 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NF2P35240 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NF2P35240 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NF2P35240 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NF2P35240 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NF2P35240 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NF2P35240 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NF2P35240 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
NF2P35240 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NF2P35240 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NF2P35240 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NF2P35240 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NF2P35240 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NF2P35240 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NF2P35240 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NF2P35240 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NF2P35240 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
NF2P35240 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NF2P35240 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NF2P35240 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NF2P35240 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NF2P35240 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NF2P35240 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NF2P35240 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NF2P35240 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NF2P35240 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NF2P35240 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NF2P35240 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
NF2P35240 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
NF2P35240 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC28.7■■■□□ 2.18
NF2P35240 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
NF2P35240 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
NF2P35240 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NF2P35240 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NF2P35240 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NF2P35240 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NF2P35240 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NF2P35240 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NF2P35240 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NF2P35240 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NF2P35240 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms