Protein–RNA interactions for Protein: P31270

HOXA11, Homeobox protein Hox-A11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA11P31270 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HOXA11P31270 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HOXA11P31270 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HOXA11P31270 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HOXA11P31270 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HOXA11P31270 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HOXA11P31270 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HOXA11P31270 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HOXA11P31270 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HOXA11P31270 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HOXA11P31270 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HOXA11P31270 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
HOXA11P31270 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HOXA11P31270 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HOXA11P31270 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HOXA11P31270 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HOXA11P31270 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
HOXA11P31270 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HOXA11P31270 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HOXA11P31270 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
HOXA11P31270 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HOXA11P31270 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HOXA11P31270 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HOXA11P31270 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HOXA11P31270 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HOXA11P31270 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HOXA11P31270 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HOXA11P31270 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HOXA11P31270 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HOXA11P31270 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HOXA11P31270 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HOXA11P31270 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HOXA11P31270 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HOXA11P31270 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
HOXA11P31270 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HOXA11P31270 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HOXA11P31270 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HOXA11P31270 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HOXA11P31270 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HOXA11P31270 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
HOXA11P31270 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HOXA11P31270 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HOXA11P31270 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HOXA11P31270 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HOXA11P31270 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HOXA11P31270 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HOXA11P31270 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HOXA11P31270 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HOXA11P31270 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HOXA11P31270 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HOXA11P31270 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HOXA11P31270 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HOXA11P31270 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HOXA11P31270 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HOXA11P31270 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HOXA11P31270 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HOXA11P31270 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HOXA11P31270 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
HOXA11P31270 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HOXA11P31270 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HOXA11P31270 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HOXA11P31270 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
HOXA11P31270 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HOXA11P31270 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HOXA11P31270 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HOXA11P31270 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HOXA11P31270 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
HOXA11P31270 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
HOXA11P31270 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HOXA11P31270 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HOXA11P31270 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HOXA11P31270 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HOXA11P31270 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HOXA11P31270 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
HOXA11P31270 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HOXA11P31270 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HOXA11P31270 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HOXA11P31270 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HOXA11P31270 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HOXA11P31270 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HOXA11P31270 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HOXA11P31270 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HOXA11P31270 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HOXA11P31270 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HOXA11P31270 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HOXA11P31270 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
HOXA11P31270 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
HOXA11P31270 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HOXA11P31270 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HOXA11P31270 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HOXA11P31270 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
HOXA11P31270 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HOXA11P31270 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HOXA11P31270 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HOXA11P31270 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HOXA11P31270 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HOXA11P31270 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HOXA11P31270 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HOXA11P31270 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HOXA11P31270 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms