Protein–RNA interactions for Protein: P25391

LAMA1, Laminin subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 3,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA1P25391 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LAMA1P25391 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LAMA1P25391 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LAMA1P25391 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LAMA1P25391 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LAMA1P25391 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LAMA1P25391 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LAMA1P25391 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LAMA1P25391 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LAMA1P25391 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LAMA1P25391 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
LAMA1P25391 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LAMA1P25391 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LAMA1P25391 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LAMA1P25391 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LAMA1P25391 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LAMA1P25391 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LAMA1P25391 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
LAMA1P25391 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LAMA1P25391 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LAMA1P25391 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LAMA1P25391 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LAMA1P25391 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LAMA1P25391 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LAMA1P25391 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LAMA1P25391 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LAMA1P25391 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LAMA1P25391 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LAMA1P25391 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LAMA1P25391 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LAMA1P25391 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LAMA1P25391 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LAMA1P25391 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LAMA1P25391 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LAMA1P25391 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LAMA1P25391 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LAMA1P25391 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LAMA1P25391 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LAMA1P25391 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LAMA1P25391 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LAMA1P25391 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LAMA1P25391 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LAMA1P25391 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LAMA1P25391 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LAMA1P25391 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LAMA1P25391 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LAMA1P25391 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LAMA1P25391 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LAMA1P25391 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LAMA1P25391 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LAMA1P25391 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
LAMA1P25391 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LAMA1P25391 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LAMA1P25391 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LAMA1P25391 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LAMA1P25391 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LAMA1P25391 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LAMA1P25391 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LAMA1P25391 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LAMA1P25391 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LAMA1P25391 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LAMA1P25391 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LAMA1P25391 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LAMA1P25391 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LAMA1P25391 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LAMA1P25391 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LAMA1P25391 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LAMA1P25391 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LAMA1P25391 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LAMA1P25391 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LAMA1P25391 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LAMA1P25391 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LAMA1P25391 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LAMA1P25391 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LAMA1P25391 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
LAMA1P25391 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
LAMA1P25391 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LAMA1P25391 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LAMA1P25391 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LAMA1P25391 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LAMA1P25391 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LAMA1P25391 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
LAMA1P25391 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
LAMA1P25391 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
LAMA1P25391 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
LAMA1P25391 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LAMA1P25391 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
LAMA1P25391 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
LAMA1P25391 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LAMA1P25391 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LAMA1P25391 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LAMA1P25391 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LAMA1P25391 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LAMA1P25391 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LAMA1P25391 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LAMA1P25391 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LAMA1P25391 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LAMA1P25391 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LAMA1P25391 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LAMA1P25391 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms