Protein–RNA interactions for Protein: P23258

TUBG1, Tubulin gamma-1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBG1P23258 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TUBG1P23258 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TUBG1P23258 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TUBG1P23258 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TUBG1P23258 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TUBG1P23258 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TUBG1P23258 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TUBG1P23258 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TUBG1P23258 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TUBG1P23258 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TUBG1P23258 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TUBG1P23258 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TUBG1P23258 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TUBG1P23258 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TUBG1P23258 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TUBG1P23258 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
TUBG1P23258 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TUBG1P23258 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TUBG1P23258 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TUBG1P23258 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TUBG1P23258 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TUBG1P23258 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TUBG1P23258 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TUBG1P23258 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TUBG1P23258 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TUBG1P23258 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TUBG1P23258 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TUBG1P23258 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TUBG1P23258 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TUBG1P23258 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TUBG1P23258 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TUBG1P23258 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TUBG1P23258 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TUBG1P23258 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TUBG1P23258 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TUBG1P23258 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
TUBG1P23258 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TUBG1P23258 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TUBG1P23258 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TUBG1P23258 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TUBG1P23258 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TUBG1P23258 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TUBG1P23258 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TUBG1P23258 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TUBG1P23258 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TUBG1P23258 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
TUBG1P23258 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
TUBG1P23258 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TUBG1P23258 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TUBG1P23258 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TUBG1P23258 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TUBG1P23258 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TUBG1P23258 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TUBG1P23258 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TUBG1P23258 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TUBG1P23258 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TUBG1P23258 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TUBG1P23258 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TUBG1P23258 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TUBG1P23258 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
TUBG1P23258 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TUBG1P23258 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
TUBG1P23258 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TUBG1P23258 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TUBG1P23258 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
TUBG1P23258 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TUBG1P23258 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TUBG1P23258 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TUBG1P23258 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TUBG1P23258 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TUBG1P23258 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TUBG1P23258 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TUBG1P23258 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
TUBG1P23258 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TUBG1P23258 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TUBG1P23258 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TUBG1P23258 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TUBG1P23258 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TUBG1P23258 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TUBG1P23258 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TUBG1P23258 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TUBG1P23258 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TUBG1P23258 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TUBG1P23258 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TUBG1P23258 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TUBG1P23258 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TUBG1P23258 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TUBG1P23258 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TUBG1P23258 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TUBG1P23258 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TUBG1P23258 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TUBG1P23258 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TUBG1P23258 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TUBG1P23258 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TUBG1P23258 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TUBG1P23258 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TUBG1P23258 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TUBG1P23258 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
TUBG1P23258 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TUBG1P23258 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms