Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
ITGA6P23229 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
ITGA6P23229 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
ITGA6P23229 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
ITGA6P23229 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
ITGA6P23229 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
ITGA6P23229 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC30.15■■■□□ 2.42
ITGA6P23229 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
ITGA6P23229 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
ITGA6P23229 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
ITGA6P23229 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
ITGA6P23229 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
ITGA6P23229 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
ITGA6P23229 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
ITGA6P23229 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
ITGA6P23229 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
ITGA6P23229 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
ITGA6P23229 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
ITGA6P23229 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
ITGA6P23229 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
ITGA6P23229 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
ITGA6P23229 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
ITGA6P23229 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
ITGA6P23229 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
ITGA6P23229 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
ITGA6P23229 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
ITGA6P23229 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
ITGA6P23229 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
ITGA6P23229 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
ITGA6P23229 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
ITGA6P23229 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
ITGA6P23229 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
ITGA6P23229 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
ITGA6P23229 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
ITGA6P23229 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
ITGA6P23229 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
ITGA6P23229 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
ITGA6P23229 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
ITGA6P23229 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ITGA6P23229 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ITGA6P23229 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
ITGA6P23229 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ITGA6P23229 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
ITGA6P23229 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
ITGA6P23229 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
ITGA6P23229 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
ITGA6P23229 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
ITGA6P23229 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ITGA6P23229 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ITGA6P23229 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
ITGA6P23229 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
ITGA6P23229 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
ITGA6P23229 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
ITGA6P23229 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
ITGA6P23229 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
ITGA6P23229 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ITGA6P23229 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ITGA6P23229 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ITGA6P23229 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ITGA6P23229 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
ITGA6P23229 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
ITGA6P23229 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ITGA6P23229 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
ITGA6P23229 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
ITGA6P23229 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
ITGA6P23229 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
ITGA6P23229 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
ITGA6P23229 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
ITGA6P23229 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC30.01■■■□□ 2.39
ITGA6P23229 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
ITGA6P23229 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
ITGA6P23229 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ITGA6P23229 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ITGA6P23229 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC30■■■□□ 2.39
ITGA6P23229 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC30■■■□□ 2.39
ITGA6P23229 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
ITGA6P23229 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
ITGA6P23229 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ITGA6P23229 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ITGA6P23229 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
ITGA6P23229 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ITGA6P23229 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ITGA6P23229 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
ITGA6P23229 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
ITGA6P23229 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
ITGA6P23229 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
ITGA6P23229 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
ITGA6P23229 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ITGA6P23229 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
ITGA6P23229 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
ITGA6P23229 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ITGA6P23229 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ITGA6P23229 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
ITGA6P23229 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
ITGA6P23229 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
ITGA6P23229 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
ITGA6P23229 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
ITGA6P23229 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC29.95■■■□□ 2.38
ITGA6P23229 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
ITGA6P23229 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms