Protein–RNA interactions for Protein: P15328

FOLR1, Folate receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOLR1P15328 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FOLR1P15328 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FOLR1P15328 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FOLR1P15328 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
FOLR1P15328 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FOLR1P15328 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FOLR1P15328 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FOLR1P15328 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FOLR1P15328 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FOLR1P15328 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FOLR1P15328 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FOLR1P15328 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FOLR1P15328 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FOLR1P15328 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FOLR1P15328 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FOLR1P15328 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FOLR1P15328 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOLR1P15328 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOLR1P15328 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOLR1P15328 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOLR1P15328 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOLR1P15328 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOLR1P15328 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOLR1P15328 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOLR1P15328 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOLR1P15328 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOLR1P15328 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOLR1P15328 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
FOLR1P15328 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
FOLR1P15328 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOLR1P15328 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOLR1P15328 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOLR1P15328 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOLR1P15328 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOLR1P15328 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOLR1P15328 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
FOLR1P15328 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOLR1P15328 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOLR1P15328 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOLR1P15328 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOLR1P15328 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOLR1P15328 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOLR1P15328 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
FOLR1P15328 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOLR1P15328 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOLR1P15328 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FOLR1P15328 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FOLR1P15328 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FOLR1P15328 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FOLR1P15328 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FOLR1P15328 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FOLR1P15328 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FOLR1P15328 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
FOLR1P15328 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FOLR1P15328 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOLR1P15328 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
FOLR1P15328 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOLR1P15328 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
FOLR1P15328 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOLR1P15328 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOLR1P15328 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOLR1P15328 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOLR1P15328 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOLR1P15328 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOLR1P15328 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FOLR1P15328 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FOLR1P15328 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FOLR1P15328 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FOLR1P15328 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOLR1P15328 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOLR1P15328 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOLR1P15328 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOLR1P15328 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOLR1P15328 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
FOLR1P15328 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOLR1P15328 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOLR1P15328 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOLR1P15328 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOLR1P15328 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOLR1P15328 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOLR1P15328 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
FOLR1P15328 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOLR1P15328 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOLR1P15328 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOLR1P15328 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOLR1P15328 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOLR1P15328 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOLR1P15328 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOLR1P15328 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FOLR1P15328 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FOLR1P15328 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOLR1P15328 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOLR1P15328 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOLR1P15328 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOLR1P15328 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOLR1P15328 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOLR1P15328 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
FOLR1P15328 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOLR1P15328 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOLR1P15328 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms