Protein–RNA interactions for Protein: P12645

BMP3, Bone morphogenetic protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP3P12645 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
BMP3P12645 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
BMP3P12645 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
BMP3P12645 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
BMP3P12645 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
BMP3P12645 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
BMP3P12645 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
BMP3P12645 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
BMP3P12645 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
BMP3P12645 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
BMP3P12645 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
BMP3P12645 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
BMP3P12645 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
BMP3P12645 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
BMP3P12645 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
BMP3P12645 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
BMP3P12645 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
BMP3P12645 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
BMP3P12645 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
BMP3P12645 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
BMP3P12645 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
BMP3P12645 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
BMP3P12645 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
BMP3P12645 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
BMP3P12645 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
BMP3P12645 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
BMP3P12645 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
BMP3P12645 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
BMP3P12645 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
BMP3P12645 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
BMP3P12645 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
BMP3P12645 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
BMP3P12645 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
BMP3P12645 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
BMP3P12645 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
BMP3P12645 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
BMP3P12645 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
BMP3P12645 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
BMP3P12645 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
BMP3P12645 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
BMP3P12645 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
BMP3P12645 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
BMP3P12645 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
BMP3P12645 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
BMP3P12645 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
BMP3P12645 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
BMP3P12645 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
BMP3P12645 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
BMP3P12645 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
BMP3P12645 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
BMP3P12645 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
BMP3P12645 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
BMP3P12645 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
BMP3P12645 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
BMP3P12645 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
BMP3P12645 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
BMP3P12645 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
BMP3P12645 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
BMP3P12645 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
BMP3P12645 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
BMP3P12645 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
BMP3P12645 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
BMP3P12645 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
BMP3P12645 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
BMP3P12645 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
BMP3P12645 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
BMP3P12645 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
BMP3P12645 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
BMP3P12645 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
BMP3P12645 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
BMP3P12645 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
BMP3P12645 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
BMP3P12645 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
BMP3P12645 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
BMP3P12645 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
BMP3P12645 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
BMP3P12645 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
BMP3P12645 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BMP3P12645 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BMP3P12645 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
BMP3P12645 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
BMP3P12645 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BMP3P12645 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BMP3P12645 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
BMP3P12645 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
BMP3P12645 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
BMP3P12645 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
BMP3P12645 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
BMP3P12645 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
BMP3P12645 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
BMP3P12645 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
BMP3P12645 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
BMP3P12645 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
BMP3P12645 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
BMP3P12645 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
BMP3P12645 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
BMP3P12645 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
BMP3P12645 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
BMP3P12645 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
BMP3P12645 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms