Protein–RNA interactions for Protein: P10589

NR2F1, COUP transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2F1P10589 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NR2F1P10589 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NR2F1P10589 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NR2F1P10589 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NR2F1P10589 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NR2F1P10589 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NR2F1P10589 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NR2F1P10589 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NR2F1P10589 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NR2F1P10589 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NR2F1P10589 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NR2F1P10589 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NR2F1P10589 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NR2F1P10589 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NR2F1P10589 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NR2F1P10589 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NR2F1P10589 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NR2F1P10589 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NR2F1P10589 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NR2F1P10589 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NR2F1P10589 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NR2F1P10589 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NR2F1P10589 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NR2F1P10589 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NR2F1P10589 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NR2F1P10589 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NR2F1P10589 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NR2F1P10589 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NR2F1P10589 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NR2F1P10589 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NR2F1P10589 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NR2F1P10589 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NR2F1P10589 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NR2F1P10589 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NR2F1P10589 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NR2F1P10589 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NR2F1P10589 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NR2F1P10589 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NR2F1P10589 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NR2F1P10589 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NR2F1P10589 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NR2F1P10589 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NR2F1P10589 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NR2F1P10589 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NR2F1P10589 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NR2F1P10589 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NR2F1P10589 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NR2F1P10589 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NR2F1P10589 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NR2F1P10589 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NR2F1P10589 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NR2F1P10589 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NR2F1P10589 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NR2F1P10589 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NR2F1P10589 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NR2F1P10589 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NR2F1P10589 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NR2F1P10589 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NR2F1P10589 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NR2F1P10589 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NR2F1P10589 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NR2F1P10589 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NR2F1P10589 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NR2F1P10589 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NR2F1P10589 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NR2F1P10589 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NR2F1P10589 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NR2F1P10589 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NR2F1P10589 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
NR2F1P10589 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NR2F1P10589 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NR2F1P10589 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NR2F1P10589 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NR2F1P10589 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NR2F1P10589 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NR2F1P10589 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NR2F1P10589 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NR2F1P10589 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NR2F1P10589 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NR2F1P10589 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NR2F1P10589 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NR2F1P10589 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NR2F1P10589 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NR2F1P10589 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NR2F1P10589 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NR2F1P10589 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NR2F1P10589 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NR2F1P10589 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NR2F1P10589 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NR2F1P10589 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NR2F1P10589 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NR2F1P10589 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NR2F1P10589 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NR2F1P10589 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NR2F1P10589 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NR2F1P10589 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NR2F1P10589 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NR2F1P10589 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NR2F1P10589 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NR2F1P10589 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms