Protein–RNA interactions for Protein: P04198

MYCN, N-myc proto-oncogene protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCNP04198 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MYCNP04198 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MYCNP04198 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MYCNP04198 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MYCNP04198 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MYCNP04198 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MYCNP04198 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MYCNP04198 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
MYCNP04198 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
MYCNP04198 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
MYCNP04198 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
MYCNP04198 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
MYCNP04198 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
MYCNP04198 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MYCNP04198 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MYCNP04198 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
MYCNP04198 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MYCNP04198 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MYCNP04198 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
MYCNP04198 AC120057.1-201ENST00000483947 663 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
MYCNP04198 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
MYCNP04198 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MYCNP04198 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
MYCNP04198 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MYCNP04198 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MYCNP04198 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MYCNP04198 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
MYCNP04198 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MYCNP04198 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MYCNP04198 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MYCNP04198 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MYCNP04198 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MYCNP04198 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
MYCNP04198 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MYCNP04198 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MYCNP04198 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MYCNP04198 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MYCNP04198 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MYCNP04198 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MYCNP04198 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MYCNP04198 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MYCNP04198 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MYCNP04198 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
MYCNP04198 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MYCNP04198 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MYCNP04198 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MYCNP04198 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MYCNP04198 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MYCNP04198 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MYCNP04198 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
MYCNP04198 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
MYCNP04198 AL589935.2-201ENST00000616471 1231 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
MYCNP04198 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MYCNP04198 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
MYCNP04198 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MYCNP04198 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MYCNP04198 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MYCNP04198 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MYCNP04198 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
MYCNP04198 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MYCNP04198 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
MYCNP04198 AC244517.3-201ENST00000616254 1235 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
MYCNP04198 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MYCNP04198 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MYCNP04198 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MYCNP04198 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MYCNP04198 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MYCNP04198 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MYCNP04198 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MYCNP04198 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MYCNP04198 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MYCNP04198 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MYCNP04198 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MYCNP04198 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MYCNP04198 STK33P1-201ENST00000423835 1218 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
MYCNP04198 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
MYCNP04198 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MYCNP04198 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MYCNP04198 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MYCNP04198 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MYCNP04198 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MYCNP04198 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
MYCNP04198 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
MYCNP04198 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MYCNP04198 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MYCNP04198 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MYCNP04198 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
MYCNP04198 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MYCNP04198 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MYCNP04198 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
MYCNP04198 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MYCNP04198 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MYCNP04198 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MYCNP04198 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MYCNP04198 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MYCNP04198 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MYCNP04198 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MYCNP04198 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MYCNP04198 ATP5L2-201ENST00000505920 799 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MYCNP04198 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms