Protein–RNA interactions for Protein: P04179

SOD2, Superoxide dismutase [Mn], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOD2P04179 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SOD2P04179 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SOD2P04179 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SOD2P04179 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SOD2P04179 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SOD2P04179 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SOD2P04179 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SOD2P04179 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SOD2P04179 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SOD2P04179 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SOD2P04179 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SOD2P04179 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SOD2P04179 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SOD2P04179 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SOD2P04179 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SOD2P04179 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SOD2P04179 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SOD2P04179 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SOD2P04179 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SOD2P04179 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SOD2P04179 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SOD2P04179 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SOD2P04179 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SOD2P04179 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SOD2P04179 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
SOD2P04179 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SOD2P04179 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SOD2P04179 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SOD2P04179 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SOD2P04179 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SOD2P04179 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SOD2P04179 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SOD2P04179 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SOD2P04179 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SOD2P04179 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SOD2P04179 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SOD2P04179 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SOD2P04179 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SOD2P04179 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SOD2P04179 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SOD2P04179 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SOD2P04179 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SOD2P04179 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SOD2P04179 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SOD2P04179 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SOD2P04179 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SOD2P04179 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SOD2P04179 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SOD2P04179 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SOD2P04179 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SOD2P04179 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SOD2P04179 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SOD2P04179 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SOD2P04179 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SOD2P04179 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SOD2P04179 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SOD2P04179 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SOD2P04179 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SOD2P04179 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SOD2P04179 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SOD2P04179 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SOD2P04179 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SOD2P04179 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SOD2P04179 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SOD2P04179 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SOD2P04179 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SOD2P04179 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SOD2P04179 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SOD2P04179 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SOD2P04179 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SOD2P04179 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SOD2P04179 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SOD2P04179 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SOD2P04179 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SOD2P04179 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SOD2P04179 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SOD2P04179 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SOD2P04179 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SOD2P04179 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SOD2P04179 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SOD2P04179 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SOD2P04179 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SOD2P04179 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SOD2P04179 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SOD2P04179 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SOD2P04179 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SOD2P04179 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SOD2P04179 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SOD2P04179 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SOD2P04179 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SOD2P04179 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SOD2P04179 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SOD2P04179 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SOD2P04179 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SOD2P04179 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SOD2P04179 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SOD2P04179 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SOD2P04179 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SOD2P04179 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SOD2P04179 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms