Protein–RNA interactions for Protein: O95707

POP4, Ribonuclease P protein subunit p29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP4O95707 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
POP4O95707 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
POP4O95707 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
POP4O95707 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
POP4O95707 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
POP4O95707 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
POP4O95707 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
POP4O95707 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
POP4O95707 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
POP4O95707 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
POP4O95707 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
POP4O95707 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
POP4O95707 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
POP4O95707 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
POP4O95707 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
POP4O95707 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
POP4O95707 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
POP4O95707 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
POP4O95707 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
POP4O95707 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
POP4O95707 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
POP4O95707 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
POP4O95707 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
POP4O95707 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
POP4O95707 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
POP4O95707 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
POP4O95707 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
POP4O95707 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
POP4O95707 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
POP4O95707 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
POP4O95707 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
POP4O95707 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
POP4O95707 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
POP4O95707 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
POP4O95707 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
POP4O95707 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
POP4O95707 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
POP4O95707 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
POP4O95707 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
POP4O95707 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
POP4O95707 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
POP4O95707 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
POP4O95707 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
POP4O95707 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
POP4O95707 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
POP4O95707 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
POP4O95707 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
POP4O95707 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
POP4O95707 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POP4O95707 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POP4O95707 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POP4O95707 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POP4O95707 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
POP4O95707 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POP4O95707 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POP4O95707 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
POP4O95707 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
POP4O95707 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
POP4O95707 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
POP4O95707 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
POP4O95707 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
POP4O95707 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
POP4O95707 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
POP4O95707 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
POP4O95707 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
POP4O95707 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
POP4O95707 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
POP4O95707 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
POP4O95707 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
POP4O95707 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
POP4O95707 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POP4O95707 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
POP4O95707 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
POP4O95707 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
POP4O95707 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POP4O95707 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POP4O95707 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POP4O95707 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POP4O95707 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
POP4O95707 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
POP4O95707 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POP4O95707 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POP4O95707 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POP4O95707 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
POP4O95707 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
POP4O95707 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POP4O95707 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POP4O95707 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POP4O95707 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POP4O95707 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
POP4O95707 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
POP4O95707 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
POP4O95707 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
POP4O95707 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
POP4O95707 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
POP4O95707 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
POP4O95707 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
POP4O95707 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
POP4O95707 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
POP4O95707 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms