Protein–RNA interactions for Protein: O95243

MBD4, Methyl-CpG-binding domain protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD4O95243 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
MBD4O95243 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
MBD4O95243 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
MBD4O95243 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
MBD4O95243 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
MBD4O95243 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
MBD4O95243 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
MBD4O95243 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
MBD4O95243 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
MBD4O95243 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
MBD4O95243 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
MBD4O95243 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
MBD4O95243 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
MBD4O95243 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
MBD4O95243 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
MBD4O95243 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
MBD4O95243 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
MBD4O95243 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
MBD4O95243 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
MBD4O95243 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
MBD4O95243 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
MBD4O95243 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
MBD4O95243 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
MBD4O95243 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
MBD4O95243 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
MBD4O95243 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
MBD4O95243 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
MBD4O95243 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
MBD4O95243 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
MBD4O95243 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
MBD4O95243 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
MBD4O95243 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
MBD4O95243 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
MBD4O95243 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
MBD4O95243 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
MBD4O95243 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
MBD4O95243 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
MBD4O95243 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
MBD4O95243 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
MBD4O95243 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
MBD4O95243 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
MBD4O95243 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
MBD4O95243 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
MBD4O95243 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
MBD4O95243 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
MBD4O95243 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
MBD4O95243 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
MBD4O95243 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
MBD4O95243 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
MBD4O95243 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
MBD4O95243 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
MBD4O95243 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
MBD4O95243 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
MBD4O95243 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
MBD4O95243 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
MBD4O95243 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
MBD4O95243 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
MBD4O95243 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
MBD4O95243 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
MBD4O95243 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
MBD4O95243 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
MBD4O95243 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
MBD4O95243 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
MBD4O95243 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
MBD4O95243 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
MBD4O95243 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
MBD4O95243 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
MBD4O95243 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
MBD4O95243 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
MBD4O95243 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
MBD4O95243 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
MBD4O95243 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
MBD4O95243 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
MBD4O95243 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
MBD4O95243 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
MBD4O95243 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
MBD4O95243 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
MBD4O95243 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
MBD4O95243 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
MBD4O95243 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
MBD4O95243 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
MBD4O95243 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
MBD4O95243 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
MBD4O95243 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
MBD4O95243 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
MBD4O95243 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
MBD4O95243 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
MBD4O95243 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
MBD4O95243 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
MBD4O95243 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
MBD4O95243 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
MBD4O95243 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
MBD4O95243 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
MBD4O95243 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
MBD4O95243 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
MBD4O95243 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
MBD4O95243 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
MBD4O95243 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
MBD4O95243 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
MBD4O95243 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms