Protein–RNA interactions for Protein: O95149

SNUPN, Snurportin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNUPNO95149 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNUPNO95149 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNUPNO95149 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNUPNO95149 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNUPNO95149 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNUPNO95149 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNUPNO95149 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNUPNO95149 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNUPNO95149 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNUPNO95149 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNUPNO95149 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNUPNO95149 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNUPNO95149 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SNUPNO95149 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNUPNO95149 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNUPNO95149 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNUPNO95149 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNUPNO95149 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNUPNO95149 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNUPNO95149 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNUPNO95149 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNUPNO95149 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNUPNO95149 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNUPNO95149 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNUPNO95149 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNUPNO95149 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNUPNO95149 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNUPNO95149 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNUPNO95149 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNUPNO95149 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNUPNO95149 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNUPNO95149 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNUPNO95149 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNUPNO95149 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNUPNO95149 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNUPNO95149 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNUPNO95149 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNUPNO95149 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNUPNO95149 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNUPNO95149 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNUPNO95149 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNUPNO95149 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNUPNO95149 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNUPNO95149 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNUPNO95149 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SNUPNO95149 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SNUPNO95149 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SNUPNO95149 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNUPNO95149 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNUPNO95149 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNUPNO95149 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNUPNO95149 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNUPNO95149 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNUPNO95149 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNUPNO95149 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNUPNO95149 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNUPNO95149 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SNUPNO95149 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNUPNO95149 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNUPNO95149 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNUPNO95149 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNUPNO95149 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNUPNO95149 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNUPNO95149 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNUPNO95149 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNUPNO95149 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNUPNO95149 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNUPNO95149 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNUPNO95149 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNUPNO95149 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNUPNO95149 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNUPNO95149 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNUPNO95149 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SNUPNO95149 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNUPNO95149 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNUPNO95149 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SNUPNO95149 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNUPNO95149 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNUPNO95149 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SNUPNO95149 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNUPNO95149 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNUPNO95149 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNUPNO95149 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNUPNO95149 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNUPNO95149 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNUPNO95149 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SNUPNO95149 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SNUPNO95149 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNUPNO95149 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNUPNO95149 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNUPNO95149 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNUPNO95149 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNUPNO95149 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SNUPNO95149 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNUPNO95149 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNUPNO95149 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNUPNO95149 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SNUPNO95149 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNUPNO95149 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNUPNO95149 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms